More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5216 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5216  superfamily I DNA/RNA helicase  100 
 
 		 722 aa  1496    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  24.21 
 
 		 702 aa  125  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2835  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.85 
 
 		 716 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  30.07 
 
 		 691 aa  105  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  30.11 
 
 		 760 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  30.22 
 
 		 689 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0875  hypothetical protein  27.08 
 
 		 712 aa  102  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  30.43 
 
 		 691 aa  102  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  29.96 
 
 		 689 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  30.22 
 
 		 689 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  29.96 
 
 		 689 aa  100  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  30.22 
 
 		 689 aa  100  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  28.26 
 
 		 689 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  30.43 
 
 		 691 aa  99  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  29.86 
 
 		 689 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  27.06 
 
 		 755 aa  97.4  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.96 
 
 		 763 aa  96.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.41 
 
 		 772 aa  97.1  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  22.58 
 
 		 702 aa  95.1  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  25.35 
 
 		 780 aa  94  9e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.89 
 
 		 763 aa  94  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  27.8 
 
 		 764 aa  94  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1206  helicase, UvrD/Rep family  28.4 
 
 		 777 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0961  ATP-dependent DNA helicase replicase  28.29 
 
 		 776 aa  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0951  ATP-dependent DNA helicase replicase  27.33 
 
 		 777 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0973  UvrD/Rep family helicase  28.4 
 
 		 776 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1040  UvrD/Rep family helicase  28.4 
 
 		 776 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  32.73 
 
 		 748 aa  91.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1118  helicase, UvrD/Rep family  28.4 
 
 		 776 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0603205 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1075  helicase, UvrD/Rep family  26.81 
 
 		 777 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1567  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  23.84 
 
 		 629 aa  89.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  28.4 
 
 		 778 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  29.31 
 
 		 778 aa  88.2  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  25.5 
 
 		 706 aa  88.6  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  27.97 
 
 		 706 aa  87.8  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  23.96 
 
 		 717 aa  87.8  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  27.55 
 
 		 753 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.11 
 
 		 659 aa  86.7  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  27.34 
 
 		 703 aa  87  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2531  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  24.49 
 
 		 636 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0022  LexA repressor  22.03 
 
 		 819 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000018035  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3516  hypothetical protein  25 
 
 		 768 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  29.19 
 
 		 787 aa  84.7  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05840  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.25 
 
 		 698 aa  82.4  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0355773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  27.85 
 
 		 785 aa  81.6  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  28.14 
 
 		 768 aa  81.3  0.00000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  29.22 
 
 		 754 aa  80.1  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1135  hypothetical protein  27.34 
 
 		 269 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0285416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2668  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  22.96 
 
 		 629 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  25.27 
 
 		 695 aa  79  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  26.37 
 
 		 680 aa  77.4  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  27.2 
 
 		 902 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.37 
 
 		 670 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  25.55 
 
 		 692 aa  75.5  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.95 
 
 		 695 aa  75.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  28.87 
 
 		 795 aa  75.1  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  28.47 
 
 		 735 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  28.57 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00160  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.31 
 
 		 706 aa  73.9  0.000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.805287 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 762 aa  73.6  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  29.72 
 
 		 776 aa  73.9  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.32 
 
 		 813 aa  72.8  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  28.44 
 
 		 742 aa  72.4  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0360  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.89 
 
 		 736 aa  71.6  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  28.51 
 
 		 742 aa  71.2  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  31.58 
 
 		 757 aa  70.9  0.00000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.71 
 
 		 710 aa  70.5  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.39 
 
 		 645 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  27.61 
 
 		 684 aa  68.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  22.52 
 
 		 719 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.59 
 
 		 804 aa  68.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.71 
 
 		 733 aa  68.2  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  26.14 
 
 		 759 aa  67.8  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  26.02 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  27.2 
 
 		 786 aa  67.8  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  27.02 
 
 		 765 aa  67.8  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  24.64 
 
 		 679 aa  67  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 702 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  26.07 
 
 		 724 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  26.07 
 
 		 724 aa  67  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1421 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 757 aa  66.6  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  26.12 
 
 		 734 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  25.68 
 
 		 724 aa  66.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  25.23 
 
 		 666 aa  65.5  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.96 
 
 		 672 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  27.44 
 
 		 792 aa  64.7  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.46 
 
 		 832 aa  64.7  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0239  hypothetical protein  26.05 
 
 		 894 aa  64.7  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.75 
 
 		 795 aa  64.7  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  26.22 
 
 		 758 aa  64.3  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  24.85 
 
 		 787 aa  64.3  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  26.67 
 
 		 788 aa  63.9  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.75 
 
 		 794 aa  63.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  24.57 
 
 		 725 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  30.07 
 
 		 829 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  28.63 
 
 		 726 aa  63.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4897  UvrD/REP helicase  22.49 
 
 		 705 aa  63.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  22.84 
 
 		 706 aa  63.2  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  25.71 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>