More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4971 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
431 aa  873    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
423 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  25.6 
 
 
468 aa  90.5  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
718 aa  83.2  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3868  histidine kinase  39.32 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  28.68 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.72 
 
 
645 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0314  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  28.57 
 
 
1399 aa  77.8  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
889 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0167  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
517 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 
441 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0352523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1431 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
1068 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 
590 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
708 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
591 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  28.37 
 
 
506 aa  73.6  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0509  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
427 aa  73.6  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.683551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 
502 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 
753 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5978  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
656 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.410257  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
510 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
493 aa  73.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1941  histidine kinase  25.68 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.531292  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3772  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 
934 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1640  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 
672 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.934605  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2376  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.54 
 
 
1407 aa  71.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2065  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 
572 aa  71.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.855683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 
1501 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
473 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  29.57 
 
 
592 aa  70.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.25 
 
 
1297 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3364  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0409308 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
446 aa  70.1  0.00000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
524 aa  70.1  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
619 aa  69.7  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3990  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
666 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.38 
 
 
666 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 
590 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10920  two component system sensor histidine kinase prrB  26.72 
 
 
446 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  27.39 
 
 
428 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  24.52 
 
 
678 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3010  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256903  decreased coverage  0.00400665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2995  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0029  sensory histidine kinase CreC  27.56 
 
 
478 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3039  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  26.17 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
799 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0184  sensory histidine kinase CreC  26.15 
 
 
481 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
500 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0363  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  26.36 
 
 
806 aa  68.6  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0224098  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.27 
 
 
664 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  23.81 
 
 
589 aa  68.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.49 
 
 
663 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3145  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187878  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
1557 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  24.43 
 
 
483 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
1039 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
752 aa  67.8  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  23.17 
 
 
553 aa  67.4  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.56 
 
 
679 aa  67  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
480 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.98 
 
 
865 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18050  signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 
458 aa  67  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.28 
 
 
469 aa  67  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 
474 aa  67  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
495 aa  67  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3308  sensor histidine kinase  25.68 
 
 
845 aa  66.6  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
744 aa  66.6  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0852  histidine kinase  32.86 
 
 
528 aa  66.6  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.152084  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
779 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  24.53 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
451 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.745871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0811  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
661 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  32.76 
 
 
498 aa  66.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
599 aa  66.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2997  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
490 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
447 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  24.53 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41270  putative two-component sensor  27.09 
 
 
428 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  24.53 
 
 
483 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.5 
 
 
607 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3895  sensory histidine kinase CreC  26.12 
 
 
472 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.952171  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
1184 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
1499 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  23.79 
 
 
505 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.68 
 
 
928 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3109  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
448 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0565  histidine kinase  27.69 
 
 
237 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  25.69 
 
 
497 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.28 
 
 
467 aa  65.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
520 aa  65.1  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 
1478 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1560  response regulator, histidine kinase  24.81 
 
 
697 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0213368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>