More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6587 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 502 aa  978    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  69.86 
 
 		 500 aa  591  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.54 
 
 		 524 aa  299  8e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.87 
 
 		 522 aa  295  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 474 aa  286  7e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.28 
 
 		 479 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 545 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.53 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.31 
 
 		 486 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  46.43 
 
 		 460 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 490 aa  263  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 501 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  42.03 
 
 		 520 aa  257  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  40.78 
 
 		 477 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.15 
 
 		 528 aa  252  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  38.75 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 473 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 		 503 aa  250  5e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.2 
 
 		 473 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.2 
 
 		 473 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 535 aa  249  7e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  45.72 
 
 		 487 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.23 
 
 		 612 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  45.41 
 
 		 467 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  41.25 
 
 		 488 aa  239  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  39.45 
 
 		 492 aa  238  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  47.87 
 
 		 550 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 488 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 		 552 aa  233  5e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.8 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  44.56 
 
 		 496 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  43.5 
 
 		 483 aa  229  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  41.08 
 
 		 559 aa  227  3e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  48.41 
 
 		 505 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 529 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  42.58 
 
 		 477 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 468 aa  223  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  41.51 
 
 		 505 aa  220  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.6 
 
 		 365 aa  219  8.999999999999998e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 		 546 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4063  histidine kinase  43.8 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 635 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  35.82 
 
 		 506 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 534 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  44.38 
 
 		 540 aa  213  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  34.36 
 
 		 497 aa  213  7.999999999999999e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  35.55 
 
 		 477 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 		 474 aa  209  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  34.67 
 
 		 648 aa  207  4e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  36.54 
 
 		 494 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 480 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  34.77 
 
 		 471 aa  206  7e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.33 
 
 		 503 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3685  ATPase domain-containing protein  37.66 
 
 		 519 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  35.97 
 
 		 469 aa  197  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  34.64 
 
 		 470 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  40.58 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  41.91 
 
 		 473 aa  191  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 477 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 504 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  36.69 
 
 		 494 aa  184  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 510 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 509 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 471 aa  177  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 469 aa  176  9e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 504 aa  175  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 		 502 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  34.1 
 
 		 490 aa  171  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3071  histidine kinase  39.16 
 
 		 369 aa  170  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000550678 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  34.39 
 
 		 481 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  35.47 
 
 		 477 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 469 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5254  histidine kinase  38.42 
 
 		 545 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  30.98 
 
 		 461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 459 aa  163  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 462 aa  163  7e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 490 aa  163  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 463 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  30.67 
 
 		 462 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 463 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 534 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 459 aa  160  6e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 463 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 466 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 475 aa  159  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30.06 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>