More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3630 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 468 aa  924    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.9 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.16 
 
 		 535 aa  389  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.8 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.8 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.8 
 
 		 473 aa  384  1e-105  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  50.11 
 
 		 485 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  48.41 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 		 522 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  53.28 
 
 		 460 aa  335  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.71 
 
 		 515 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  45.51 
 
 		 487 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  42.43 
 
 		 477 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  43.31 
 
 		 496 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 		 479 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 545 aa  273  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  46.6 
 
 		 505 aa  273  6e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  45.74 
 
 		 529 aa  266  5.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.35 
 
 		 524 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  40.81 
 
 		 601 aa  258  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 528 aa  257  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  44.38 
 
 		 520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.11 
 
 		 486 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 		 474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4063  histidine kinase  49 
 
 		 525 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 		 488 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  48.45 
 
 		 467 aa  247  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  40.62 
 
 		 540 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  39.76 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  41.22 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  40.13 
 
 		 477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3685  ATPase domain-containing protein  42.31 
 
 		 519 aa  237  3e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  44.97 
 
 		 550 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 490 aa  237  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 		 505 aa  234  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.07 
 
 		 502 aa  233  5e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 500 aa  230  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 635 aa  228  1e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 		 509 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  43.62 
 
 		 470 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  40.99 
 
 		 494 aa  220  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 532 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 532 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 517 aa  219  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  46.5 
 
 		 477 aa  218  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  35.91 
 
 		 506 aa  216  9e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  42.23 
 
 		 471 aa  212  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.47 
 
 		 365 aa  210  5e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  39.12 
 
 		 503 aa  209  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  39.84 
 
 		 559 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 480 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  33.49 
 
 		 648 aa  204  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  36.84 
 
 		 490 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.81 
 
 		 471 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.92 
 
 		 612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  44.18 
 
 		 474 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  34.85 
 
 		 477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 510 aa  197  5.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  36.16 
 
 		 486 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.09 
 
 		 534 aa  194  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.06 
 
 		 469 aa  193  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 		 509 aa  193  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  42.82 
 
 		 473 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  36.31 
 
 		 481 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 504 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 474 aa  189  7e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 459 aa  189  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  35.74 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 		 546 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  36.72 
 
 		 496 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  37.07 
 
 		 469 aa  183  7e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  36.91 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  37.27 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 455 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2798  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 490 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000774606  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 470 aa  178  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  41.04 
 
 		 469 aa  176  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  40.58 
 
 		 423 aa  176  8e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.99 
 
 		 502 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 406 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  38.12 
 
 		 565 aa  172  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 493 aa  172  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 		 585 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 585 aa  172  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.35 
 
 		 587 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 639 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  40.35 
 
 		 587 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  40.35 
 
 		 587 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  40.35 
 
 		 587 aa  171  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.46 
 
 		 477 aa  171  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  40.35 
 
 		 587 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  40.35 
 
 		 587 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  40.35 
 
 		 587 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  35.86 
 
 		 518 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 524 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 459 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  39.91 
 
 		 587 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>