More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4063 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4063  histidine kinase  100 
 
 		 525 aa  1028    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3685  ATPase domain-containing protein  83.46 
 
 		 519 aa  661    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  47.62 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 522 aa  340  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  46.27 
 
 		 496 aa  329  6e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.63 
 
 		 473 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.49 
 
 		 535 aa  323  3e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.44 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.44 
 
 		 473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  39.74 
 
 		 520 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  44.58 
 
 		 485 aa  310  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 		 515 aa  309  6.999999999999999e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  43.31 
 
 		 488 aa  304  3.0000000000000004e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.76 
 
 		 479 aa  303  4.0000000000000003e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.05 
 
 		 528 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  50.26 
 
 		 487 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  42.41 
 
 		 477 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  48.57 
 
 		 505 aa  288  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.08 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.07 
 
 		 474 aa  272  9e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 		 545 aa  272  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 		 524 aa  267  4e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.75 
 
 		 488 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 529 aa  266  1e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 		 601 aa  263  4e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.43 
 
 		 486 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.16 
 
 		 502 aa  256  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.04 
 
 		 490 aa  253  6e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 		 500 aa  253  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  41.88 
 
 		 550 aa  246  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 		 505 aa  244  3e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  39.48 
 
 		 540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  40.46 
 
 		 467 aa  238  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.66 
 
 		 501 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  38.14 
 
 		 483 aa  233  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  38.63 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  39.9 
 
 		 506 aa  227  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  38.61 
 
 		 492 aa  223  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  56.77 
 
 		 365 aa  221  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 517 aa  216  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 532 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 532 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 		 612 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  34.76 
 
 		 497 aa  213  7e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 		 534 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 546 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  34.39 
 
 		 559 aa  209  1e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 510 aa  201  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  33.08 
 
 		 471 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  37.33 
 
 		 469 aa  195  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  31.91 
 
 		 470 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  39.78 
 
 		 477 aa  194  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  37.69 
 
 		 503 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 526 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  29.45 
 
 		 648 aa  190  5e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 504 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 474 aa  189  1e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 509 aa  186  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  34.86 
 
 		 490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  42.09 
 
 		 473 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  35.74 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  32.45 
 
 		 481 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  39.02 
 
 		 469 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 469 aa  173  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  29.55 
 
 		 496 aa  172  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 459 aa  170  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  31.9 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  32.7 
 
 		 494 aa  167  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 468 aa  167  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 455 aa  166  8e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  35.44 
 
 		 477 aa  166  8e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  40.26 
 
 		 584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  36.14 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 466 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 470 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  41.05 
 
 		 587 aa  161  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  41.05 
 
 		 587 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 502 aa  161  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  39.66 
 
 		 587 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  40.09 
 
 		 587 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  41.05 
 
 		 587 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  41.05 
 
 		 587 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  30.06 
 
 		 466 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  30.03 
 
 		 466 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  40.09 
 
 		 587 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  30.06 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.59 
 
 		 600 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  29.94 
 
 		 466 aa  160  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>