More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0721 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  53.22 
 
 		 635 aa  635    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  100 
 
 		 648 aa  1339    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  35.67 
 
 		 520 aa  296  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 545 aa  270  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  36.04 
 
 		 540 aa  259  1e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 479 aa  229  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 529 aa  224  3e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 601 aa  223  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 528 aa  222  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 522 aa  220  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  40.42 
 
 		 467 aa  219  8.999999999999998e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  38.6 
 
 		 477 aa  210  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 		 524 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 		 505 aa  199  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.53 
 
 		 500 aa  193  9e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 474 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  29.71 
 
 		 487 aa  188  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 		 612 aa  184  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 535 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 502 aa  183  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  29.69 
 
 		 485 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.38 
 
 		 486 aa  180  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  29.85 
 
 		 492 aa  180  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 473 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 503 aa  177  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  26.66 
 
 		 471 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 473 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 		 473 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 490 aa  175  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 517 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 532 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 		 532 aa  173  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  32.37 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  29.36 
 
 		 483 aa  173  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.65 
 
 		 503 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  32.13 
 
 		 477 aa  170  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  33.7 
 
 		 506 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 		 509 aa  168  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  34.64 
 
 		 550 aa  168  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  25.59 
 
 		 470 aa  167  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 469 aa  167  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 552 aa  166  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  33.07 
 
 		 559 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  28.85 
 
 		 496 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 459 aa  165  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  35.88 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  30.46 
 
 		 505 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 468 aa  162  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 546 aa  161  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  27.54 
 
 		 497 aa  160  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 471 aa  160  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 		 524 aa  159  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 534 aa  158  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  28.6 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  31.99 
 
 		 486 aa  151  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  29.64 
 
 		 477 aa  145  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  32.02 
 
 		 494 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  30.97 
 
 		 469 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 526 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 504 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  27.27 
 
 		 494 aa  140  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 469 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 510 aa  140  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 504 aa  139  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.3 
 
 		 477 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 470 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 475 aa  138  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2674  two-component sensor histidine kinase  27.54 
 
 		 471 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  29.97 
 
 		 469 aa  137  7.000000000000001e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  27.42 
 
 		 490 aa  137  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.35 
 
 		 456 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 502 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 509 aa  135  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 455 aa  134  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 		 462 aa  134  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.15 
 
 		 463 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  28.61 
 
 		 497 aa  134  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  28.07 
 
 		 496 aa  134  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  31.98 
 
 		 473 aa  134  6.999999999999999e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3054  histidine kinase  29.01 
 
 		 397 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.784699  hitchhiker  0.000293992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.65 
 
 		 461 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.61 
 
 		 463 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 365 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 513 aa  131  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  29.58 
 
 		 469 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 474 aa  130  6e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.68 
 
 		 495 aa  130  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  27.35 
 
 		 463 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 463 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  27.13 
 
 		 463 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  27.86 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 600 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>