More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5143 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5143  histidine kinase  100 
 
 
496 aa  996    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0703366  normal  0.553184 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  59.14 
 
 
460 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4658  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 
522 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.702932  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1582  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.93 
 
 
535 aa  320  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5174  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 
503 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4972  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.58 
 
 
473 aa  303  5.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10773  two component system response sensor kinase membrane associated phoR  43.93 
 
 
485 aa  303  6.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.680907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4589  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 
473 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4677  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.28 
 
 
473 aa  302  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0338673  normal  0.745683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.88 
 
 
515 aa  301  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  38.68 
 
 
520 aa  299  6e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3275  histidine kinase  53.02 
 
 
487 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.31 
 
 
479 aa  289  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3685  ATPase domain-containing protein  45.86 
 
 
519 aa  286  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3630  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.31 
 
 
468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0579  histidine kinase  47.17 
 
 
505 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  40.67 
 
 
477 aa  284  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4063  histidine kinase  51.34 
 
 
525 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.243672 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0823  ATP-binding region ATPase domain protein  41.34 
 
 
488 aa  280  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121658  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  41.68 
 
 
545 aa  276  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
474 aa  268  2e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04120  signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
601 aa  262  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427723  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4917  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.89 
 
 
486 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
529 aa  256  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3621  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
528 aa  254  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0211991  normal  0.941286 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.59 
 
 
524 aa  253  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21630  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
505 aa  251  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0359788  normal  0.0598473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  42.27 
 
 
506 aa  246  6e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0235  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  45.36 
 
 
500 aa  246  6e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.85 
 
 
501 aa  246  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6587  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
502 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.537793  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1822  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.03 
 
 
488 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0839  histidine kinase  39.75 
 
 
467 aa  239  5.999999999999999e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal  0.20827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4407  histidine kinase  42.64 
 
 
492 aa  239  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 
509 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.13 
 
 
552 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  37.65 
 
 
483 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
612 aa  229  8e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0417702  normal  0.376991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0220  histidine kinase  44.62 
 
 
550 aa  227  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.122039  hitchhiker  0.00447833 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  45.92 
 
 
470 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  44.71 
 
 
477 aa  225  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
532 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.19 
 
 
517 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
532 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2938  histidine kinase  38.36 
 
 
540 aa  223  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.330217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.48 
 
 
365 aa  223  8e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  37.63 
 
 
471 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2267  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 
546 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0359214  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0803  histidine kinase  34.64 
 
 
497 aa  220  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 
490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438349  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1723  histidine kinase  38.11 
 
 
494 aa  219  6e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.24 
 
 
534 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222647  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
510 aa  206  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4689  histidine kinase  43.87 
 
 
473 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3696  ATPase domain-containing protein  36.3 
 
 
469 aa  204  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0256  signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 
474 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  36.67 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0006  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
635 aa  196  6e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0721  sensor histidine kinase/response regulator  29.89 
 
 
648 aa  196  6e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.213488 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  37.56 
 
 
559 aa  195  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2094  histidine kinase  34.1 
 
 
477 aa  193  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.854924  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  37.15 
 
 
486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  43.14 
 
 
526 aa  190  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
469 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
480 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  36.55 
 
 
481 aa  187  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
504 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6148  histidine kinase  42.77 
 
 
494 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.172776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  35.42 
 
 
490 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
459 aa  182  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  38.14 
 
 
477 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
471 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0378  histidine kinase  40.18 
 
 
469 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 
504 aa  179  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
509 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  30.61 
 
 
466 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  30.38 
 
 
468 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  30.61 
 
 
466 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  35.38 
 
 
466 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
466 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
466 aa  177  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
466 aa  177  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  30.23 
 
 
466 aa  177  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
459 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  35.53 
 
 
466 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  35.53 
 
 
466 aa  172  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  35.71 
 
 
466 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
469 aa  171  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  37.5 
 
 
565 aa  169  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  36.52 
 
 
469 aa  169  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  36.16 
 
 
455 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  35.03 
 
 
477 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  42.92 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.62 
 
 
502 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.202085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  39.25 
 
 
593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1807  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
490 aa  163  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0131538  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
474 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 
585 aa  162  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  42.51 
 
 
416 aa  161  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0472  hypothetical protein  36.73 
 
 
252 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>