37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4572 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4572  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  519  1e-146  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0341  hypothetical protein  29.84 
 
 		 259 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5361  Anti-sigma K factor RskA  30.86 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.655522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3072  Anti-sigma-K factor RskA  33.81 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.865859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1668  hypothetical protein  30.89 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0134215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1598  hypothetical protein  29.5 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.240945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3291  hypothetical protein  37.11 
 
 		 248 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0227  putative transmembrane anti-sigma factor  27.11 
 
 		 277 aa  61.2  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0511  hypothetical protein  24.82 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.194479  normal  0.142642 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14900  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  37.37 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111779  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1582  hypothetical protein  26.29 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0544  hypothetical protein  24.8 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4536  hypothetical protein  26.09 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.369604  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0097  Anti-sigma-K factor RskA  35 
 
 		 266 aa  52.4  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0432899  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0347  hypothetical protein  25.81 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1908  hypothetical protein  32.14 
 
 		 277 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1817  hypothetical protein  27.91 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.836405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4208  hypothetical protein  40.79 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0607  putative anti-sigmaE protein  26.75 
 
 		 210 aa  50.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.116214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3980  hypothetical protein  24.81 
 
 		 246 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24724  normal  0.367091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0897  putative transmembrane anti-sigma factor  26.24 
 
 		 291 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0263954  unclonable  0.0000000174741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3758  hypothetical protein  35.96 
 
 		 294 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.450745  normal  0.0113706 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17090  hypothetical protein  32.22 
 
 		 241 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.6252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5902  hypothetical protein  27.47 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2738  hypothetical protein  26.28 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.300284  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2946  hypothetical protein  25.58 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00896315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1906  hypothetical protein  25.6 
 
 		 287 aa  45.8  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4928  hypothetical protein  33.71 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.22925  normal  0.0520605 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2777  Anti-sigma K factor RskA  25.91 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01781  hypothetical protein  25.72 
 
 		 277 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4263  hypothetical protein  25.93 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  0.123734 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3433  hypothetical protein  31.09 
 
 		 267 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4753  hypothetical protein  31.46 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2037  putative transmembrane anti-sigma factor  30.34 
 
 		 313 aa  42.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4459  hypothetical protein  31.46 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0607277  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4372  hypothetical protein  31.46 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.787659  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2462  hypothetical protein  24.07 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000051689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>