More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2247 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
535 aa  1079    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  42.28 
 
 
531 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  39.89 
 
 
530 aa  346  6e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  39.8 
 
 
530 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  35.37 
 
 
590 aa  277  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  32.51 
 
 
594 aa  237  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  30.56 
 
 
520 aa  230  6e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  30.7 
 
 
535 aa  229  8e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 
544 aa  224  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  31.37 
 
 
544 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 
538 aa  209  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1483  extracellular solute-binding protein  29.87 
 
 
542 aa  207  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3311  putative binding protein  31.05 
 
 
535 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43332  normal  0.120975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02892  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  30.86 
 
 
535 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.922865  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0680  extracellular solute-binding protein family 5  30.86 
 
 
535 aa  204  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02842  hypothetical protein  30.86 
 
 
535 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.81173  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3198  putative binding protein  30.86 
 
 
535 aa  204  4e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0677  putative binding protein  30.86 
 
 
535 aa  204  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  29.74 
 
 
556 aa  203  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  28.63 
 
 
541 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 
556 aa  202  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  29.32 
 
 
541 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  29.03 
 
 
532 aa  201  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0943  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 
558 aa  199  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0446161  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  28.96 
 
 
558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4331  putative binding protein  30.27 
 
 
535 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0538  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.6 
 
 
525 aa  196  7e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.461639  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  29.93 
 
 
561 aa  196  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1751  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 
538 aa  196  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.150343  normal  0.0954392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 
547 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  27.19 
 
 
545 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  27.89 
 
 
544 aa  194  4e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
540 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  29.64 
 
 
540 aa  192  9e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  28.68 
 
 
533 aa  192  9e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0468  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.6 
 
 
525 aa  192  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  30.04 
 
 
526 aa  192  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.88 
 
 
536 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 
533 aa  192  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.64 
 
 
536 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  26.64 
 
 
536 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.52 
 
 
536 aa  191  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3598  extracellular solute-binding protein  28.37 
 
 
525 aa  190  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000427863  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  29.47 
 
 
538 aa  190  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0020  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
558 aa  189  9e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.21 
 
 
545 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0180  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.44 
 
 
529 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  29.22 
 
 
526 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2000  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 
550 aa  189  1e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 
545 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  29.21 
 
 
525 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  29.11 
 
 
543 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  29.84 
 
 
540 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.9 
 
 
558 aa  187  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
533 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.34 
 
 
536 aa  187  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 
552 aa  187  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4404  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 
536 aa  187  5e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  28 
 
 
532 aa  187  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  28.63 
 
 
545 aa  186  8e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.7 
 
 
558 aa  186  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0177  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27 
 
 
529 aa  186  9e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.584873  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2372  extracellular solute-binding protein family 5  28.09 
 
 
543 aa  186  9e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.220552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  28.71 
 
 
532 aa  186  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.34 
 
 
536 aa  186  9e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  27.7 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  27.7 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 
558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  28.91 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.7 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.7 
 
 
558 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  28.91 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.7 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  28.91 
 
 
543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.67 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  29.1 
 
 
543 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  27.5 
 
 
543 aa  184  3e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  27.08 
 
 
536 aa  184  3e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  26.7 
 
 
536 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1698  extracellular solute-binding protein family 5  29.28 
 
 
537 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  28.71 
 
 
543 aa  184  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.6 
 
 
525 aa  182  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  27.82 
 
 
535 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 
545 aa  182  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  28.54 
 
 
525 aa  182  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  28.01 
 
 
544 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 
547 aa  181  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1223  4-phytase  29.26 
 
 
589 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3462  extracellular solute-binding protein  29.84 
 
 
552 aa  180  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0173201  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 
528 aa  180  5.999999999999999e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3599  extracellular solute-binding protein  27.52 
 
 
525 aa  179  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 
549 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  28.54 
 
 
532 aa  178  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1982  extracellular solute-binding protein  29.66 
 
 
543 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.17175 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.82 
 
 
534 aa  178  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  27.7 
 
 
537 aa  177  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  28.52 
 
 
537 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1731  extracellular solute-binding protein family 5  28.6 
 
 
539 aa  177  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.308556  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  29.53 
 
 
526 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  28.33 
 
 
537 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>