More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1710 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1710  response regulator receiver protein  100 
 
 
155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.198048  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1609  response regulator receiver protein  66.44 
 
 
155 aa  214  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2148  response regulator receiver protein  42.03 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2144  response regulator receiver protein  40.56 
 
 
148 aa  117  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1271  response regulator receiver protein  39.42 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1833  response regulator receiver protein  37.06 
 
 
136 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0205  response regulator receiver protein  36.88 
 
 
136 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.879703 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4403  response regulator receiver protein  35.92 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1826  sensor protein TorS  30.87 
 
 
1000 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.811683  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.37 
 
 
1218 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4176  response regulator receiver protein  33.08 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
1033 aa  65.1  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0593  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
397 aa  64.7  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.177467  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3148  response regulator receiver protein  30.71 
 
 
143 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
930 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
870 aa  62.8  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0248  response regulator receiver protein  32.33 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2207  response regulator receiver protein  27.83 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.556547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1185 aa  61.6  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2690  response regulator receiver domain-containing protein  34.92 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3206  response regulator receiver protein  39.73 
 
 
126 aa  60.5  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.901142  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.26 
 
 
655 aa  60.5  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3859  response regulator receiver protein  31.93 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1646  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
391 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0178265 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
835 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1496  response regulator receiver protein  32.81 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.270703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
865 aa  59.7  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.1 
 
 
700 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.434534  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
526 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04818  sensor histidine kinase/response regulator, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06140)  29.79 
 
 
1243 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.25404  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
663 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.267585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  30.15 
 
 
1179 aa  58.9  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.24 
 
 
1021 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  30.2 
 
 
861 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3793  multi-sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
664 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.191798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1310 aa  58.9  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 
776 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
657 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1222 aa  58.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
664 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
995 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3212  response regulator receiver protein  27.73 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1307  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
391 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2107  response regulator receiver protein  29.77 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3271  response regulator receiver protein  32 
 
 
120 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1357  response regulator receiver protein  29.37 
 
 
148 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.463554  normal  0.0634619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2068  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
948 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 
1406 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 
964 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2473  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
1792 aa  57.8  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.443525 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
636 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0480  putative PAS/PAC sensor protein  31.54 
 
 
1686 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2751  response regulator receiver domain-containing protein  29.32 
 
 
151 aa  57.4  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.301483  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1368  response regulator receiver protein  30.43 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.136056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2037  response regulator receiver domain-containing protein  27.91 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0651814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
866 aa  57.4  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
623 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.75 
 
 
1222 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  30.95 
 
 
884 aa  57.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.06 
 
 
918 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2946  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.1 
 
 
777 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.06 
 
 
918 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1749  two component response regulator  30.77 
 
 
123 aa  57.4  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.417168  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  28.37 
 
 
1070 aa  57.4  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.06 
 
 
918 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.06 
 
 
918 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.06 
 
 
918 aa  57.4  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
778 aa  57.4  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.48 
 
 
1088 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.57 
 
 
918 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4037  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  30.53 
 
 
659 aa  56.2  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45485  ethylene receptor 1  24.65 
 
 
833 aa  57  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.454805  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
720 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
938 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  28.79 
 
 
438 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  32.23 
 
 
1303 aa  57  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  40 
 
 
524 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 
529 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3548  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1681 aa  56.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  25.95 
 
 
399 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0925  response regulator receiver protein  30 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4198  response regulator receiver domain-containing protein  28.06 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3142  response regulator receiver protein  29.41 
 
 
164 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.460947  normal  0.158986 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  32.56 
 
 
693 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
876 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0130  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  32.77 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.4 
 
 
927 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  28.91 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1817  response regulator receiver domain-containing protein  26.92 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.202035 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 
1954 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
1681 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1047  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.69 
 
 
952 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.017027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0147  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.906045  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4747  putative response regulator in two-component regulatory system (CheY-like protein)  34.25 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0229347  normal  0.575549 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  28.91 
 
 
129 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  26.52 
 
 
1060 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
1279 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4377  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 
666 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
2654 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>