47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1231 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
1049 aa  2119    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  33.17 
 
 
1656 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  31.87 
 
 
2170 aa  258  4e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  36.63 
 
 
1762 aa  215  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  28.89 
 
 
1853 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  29.01 
 
 
1574 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  28.79 
 
 
1853 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  32.21 
 
 
2706 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  31.52 
 
 
1193 aa  145  4e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  29.28 
 
 
3802 aa  136  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  34.82 
 
 
1461 aa  82.8  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  30.51 
 
 
970 aa  64.3  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  57.83 
 
 
830 aa  61.6  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  50 
 
 
356 aa  60.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  34.91 
 
 
503 aa  58.5  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  53.61 
 
 
1394 aa  58.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 
503 aa  58.2  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  46 
 
 
846 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  28.3 
 
 
1170 aa  54.7  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2980  oxidoreductase, putative  24.38 
 
 
398 aa  52.4  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  37.5 
 
 
662 aa  52.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  38.61 
 
 
433 aa  52.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  32 
 
 
524 aa  52.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0333  glucose sorbosone dehydrogenase  22.77 
 
 
387 aa  52  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.952569  normal  0.559953 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2792  hypothetical protein  33.05 
 
 
938 aa  50.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  30.11 
 
 
1171 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2218  NHL repeat-containing protein  27.69 
 
 
430 aa  49.7  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.493276  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  29.56 
 
 
1175 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  51.22 
 
 
453 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  33.63 
 
 
933 aa  48.9  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4955  glucose sorbosone dehydrogenase  25.41 
 
 
432 aa  48.9  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.166983 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4441  glucose sorbosone dehydrogenase  25.41 
 
 
428 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.672706 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4905  glucose sorbosone dehydrogenase  25.41 
 
 
428 aa  48.1  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.562045  normal  0.994161 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4391  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  25.36 
 
 
487 aa  48.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.454131  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04111  dehydrogenase  23.4 
 
 
392 aa  47.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  26.91 
 
 
841 aa  46.6  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  50.7 
 
 
449 aa  47  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2188  cytochrome c class I  25.29 
 
 
1151 aa  47  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0679  hypothetical protein  50.6 
 
 
625 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00239733  hitchhiker  0.00966173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  20.63 
 
 
403 aa  46.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  20.63 
 
 
403 aa  46.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  55.74 
 
 
914 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  51.72 
 
 
456 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1291  mucin 2, intestinal/tracheal  47.44 
 
 
2353 aa  46.6  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.62338 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5339  glucose sorbosone dehydrogenase  27.31 
 
 
413 aa  46.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.384177  normal  0.194322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0098  hypothetical protein  44.94 
 
 
605 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0997115  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  49.45 
 
 
455 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>