More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0463 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0463  helicase c2  100 
 
 		 730 aa  1489    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0718718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  24.32 
 
 		 843 aa  163  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  25.6 
 
 		 832 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  23.76 
 
 		 840 aa  150  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  24.36 
 
 		 838 aa  144  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  22.31 
 
 		 729 aa  140  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  24.39 
 
 		 830 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.8 
 
 		 934 aa  134  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  21.83 
 
 		 851 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.86 
 
 		 934 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.17 
 
 		 934 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  23.34 
 
 		 757 aa  131  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  23.73 
 
 		 934 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.24 
 
 		 934 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.98 
 
 		 758 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.98 
 
 		 729 aa  126  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.53 
 
 		 692 aa  125  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  32.14 
 
 		 668 aa  124  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  22.67 
 
 		 681 aa  123  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2178  helicase c2  23.75 
 
 		 685 aa  120  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1957  helicase c2  29.55 
 
 		 699 aa  120  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0276528  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  30.97 
 
 		 665 aa  114  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  30.97 
 
 		 665 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  30.97 
 
 		 665 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11361  ATP-dependent helicase dinG  29.6 
 
 		 664 aa  114  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00520548  normal  0.0965757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  28.66 
 
 		 660 aa  112  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29270  DNA helicase, Rad3  29.6 
 
 		 684 aa  111  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  20.88 
 
 		 721 aa  109  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4298  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.92 
 
 		 666 aa  109  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.641288 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  33.61 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  33.61 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2347  helicase c2  26.79 
 
 		 670 aa  108  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.490547  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  33.61 
 
 		 634 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  21.44 
 
 		 711 aa  108  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.53 
 
 		 927 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  32.35 
 
 		 639 aa  107  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0995  helicase c2  28.69 
 
 		 681 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.900844  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1025  DNA polymerase III, epsilon subunit/ATP-dependent helicase DinG  23.58 
 
 		 902 aa  106  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1280  helicase c2  29.1 
 
 		 677 aa  106  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0225088  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  31.52 
 
 		 673 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  31.1 
 
 		 651 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1566  helicase c2  28.69 
 
 		 844 aa  105  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102401  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1514  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  24.03 
 
 		 897 aa  105  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.103927  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  28.33 
 
 		 876 aa  105  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1543  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  24.03 
 
 		 897 aa  105  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.959984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.98 
 
 		 694 aa  105  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  31.93 
 
 		 639 aa  104  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10610  DNA helicase, Rad3  26.57 
 
 		 673 aa  103  9e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.382167  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  29.43 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3824  helicase c2  29.41 
 
 		 676 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00296278  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  32.77 
 
 		 634 aa  103  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  31.8 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  31.8 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  31.8 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  31.8 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  31.8 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  30.63 
 
 		 754 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  28.85 
 
 		 646 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  31.8 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  27.42 
 
 		 765 aa  102  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  31.8 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  26.64 
 
 		 672 aa  103  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  31.8 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  31.8 
 
 		 636 aa  102  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  29.54 
 
 		 664 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.22 
 
 		 691 aa  101  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.06 
 
 		 691 aa  101  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  29.08 
 
 		 743 aa  100  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  30.27 
 
 		 636 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  30.27 
 
 		 636 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  30.27 
 
 		 636 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  30.27 
 
 		 636 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0323  helicase c2  27.5 
 
 		 699 aa  99.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323796 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0532  helicase c2  28.57 
 
 		 649 aa  99.8  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  30.27 
 
 		 636 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1812  helicase c2  26.88 
 
 		 706 aa  99.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  28.73 
 
 		 725 aa  99  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.04 
 
 		 690 aa  99  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.04 
 
 		 690 aa  98.2  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  31.51 
 
 		 649 aa  97.8  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.62 
 
 		 930 aa  97.4  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  31.51 
 
 		 636 aa  97.4  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1469  helicase c2  26.06 
 
 		 685 aa  97.4  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000142659 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2170  putative ATP-dependent helicase  29.53 
 
 		 752 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.779886  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  35.11 
 
 		 636 aa  97.1  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  26.98 
 
 		 649 aa  96.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  29.5 
 
 		 713 aa  95.9  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0280  helicase c2  24.91 
 
 		 683 aa  96.3  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0332575 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  30.34 
 
 		 755 aa  95.9  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  28.62 
 
 		 667 aa  96.3  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  30.31 
 
 		 929 aa  95.9  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1467  helicase c2  26.16 
 
 		 690 aa  96.3  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0659778  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  29.41 
 
 		 639 aa  96.3  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  29.13 
 
 		 749 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  27.6 
 
 		 725 aa  96.3  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0081  putative ATP-dependent helicase  29.13 
 
 		 752 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.892999  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2336  ATP-dependent helicase, putative  29.13 
 
 		 752 aa  95.5  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.13 
 
 		 957 aa  95.5  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  32.62 
 
 		 707 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1815  putative ATP-dependent helicase  29.13 
 
 		 752 aa  95.5  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>