More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0399 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.220898  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1370  MotA/TolQ/ExbB proton channel  66.9 
 
 		 147 aa  207  4e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1542  MotA/TolQ/ExbB proton channel  60.43 
 
 		 146 aa  171  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2067  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.36 
 
 		 148 aa  169  9e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4648  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.94 
 
 		 218 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0170  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.508954  normal  0.361198 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3670  tonB-system energizer ExbB  45.74 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.71 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.09 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.7 
 
 		 209 aa  96.3  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0873  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.79 
 
 		 240 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362466  normal  0.116747 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1465  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.31 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.163062  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  48.48 
 
 		 225 aa  93.6  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  54.32 
 
 		 223 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1002  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.56 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2942  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48 
 
 		 236 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000153109  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.68 
 
 		 225 aa  87.8  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0747  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.15 
 
 		 337 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3061  tonB-system energizer ExbB  43.31 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.438848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0703  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.34 
 
 		 400 aa  86.7  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.515787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  55.41 
 
 		 268 aa  86.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  43.43 
 
 		 236 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1655  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.82 
 
 		 286 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.41 
 
 		 235 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1761  TolQ protein  41.41 
 
 		 237 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  46.74 
 
 		 232 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.87 
 
 		 229 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0413  TolQ  41.41 
 
 		 237 aa  85.5  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0635098  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2040  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.34 
 
 		 421 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.853694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.13 
 
 		 247 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.51 
 
 		 224 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 		 229 aa  85.5  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0627  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.58 
 
 		 149 aa  85.5  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.224734  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  40.87 
 
 		 229 aa  85.1  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.84 
 
 		 224 aa  85.1  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.39 
 
 		 251 aa  85.1  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  53.33 
 
 		 239 aa  85.5  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.51 
 
 		 228 aa  84.7  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.38 
 
 		 223 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  40 
 
 		 229 aa  84.7  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  49.38 
 
 		 225 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2666  tonB-system energizer ExbB  41.73 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.36 
 
 		 223 aa  84.3  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0691  biopolymer transport protein  42.62 
 
 		 151 aa  84.3  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0618504  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.38 
 
 		 224 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  47.67 
 
 		 224 aa  84.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 		 228 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 		 228 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  47.67 
 
 		 224 aa  84  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1511  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.84 
 
 		 221 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0055126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0718  tonB-system energizer ExbB  35.66 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1606  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.84 
 
 		 221 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556463  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3967  tonB-system energizer ExbB  47.19 
 
 		 303 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 235 aa  84  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 		 228 aa  84  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.39 
 
 		 232 aa  84  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  48.75 
 
 		 245 aa  84  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 229 aa  84  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  54.93 
 
 		 236 aa  83.6  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1566  Tol-Pal system, TolQ  46.67 
 
 		 263 aa  83.6  8e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967145 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4004  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.76 
 
 		 267 aa  84  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.894756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  37.5 
 
 		 231 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.16 
 
 		 228 aa  83.6  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  37.5 
 
 		 231 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  37.5 
 
 		 231 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  37.5 
 
 		 231 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1588  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.74 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  39.64 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0732  TOLQ-like transport transmembrane protein  47.13 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.682761 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2579  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.96 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  39.64 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.28 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.64 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0920  biopolymer transport protein, ExbB  41.96 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2996  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.96 
 
 		 355 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.501984  normal  0.346367 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.05 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  39.64 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02687  tolQ protein  45 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000858548  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  54.29 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.32 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0847  TonB-system energizer ExbB  40.6 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000465071  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.74 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0681  protein TolQ  47.13 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458824  normal  0.677661 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1250  TolQ proton channel  45.74 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.918211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  41.41 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  44.33 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1241  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.52 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2090  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.06 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0670804 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.16 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  37.72 
 
 		 231 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1980  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.05327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4540  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.23 
 
 		 301 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  49.38 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  42.42 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  43.82 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  43.82 
 
 		 224 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  41 
 
 		 257 aa  81.6  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  43.62 
 
 		 225 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  40.4 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0792  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.51 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>