42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0303 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0303  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  484  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548607  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2367  SapC family protein  24.4 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1708  hypothetical protein  24.77 
 
 
461 aa  62.4  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2202  SapC family protein  24.55 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.504396  normal  0.230762 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1307  SapC family protein  23.79 
 
 
238 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.537479 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1210  SapC family protein  24.76 
 
 
239 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.007094  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2408  SapC family protein  23.44 
 
 
266 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0940  hypothetical protein  25.89 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00274123  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2181  SapC family protein  25.6 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000117047  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4693  SapC family protein  28.32 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2877  SapC family protein  25.46 
 
 
233 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.193841  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0613  SapC-related protein  21.65 
 
 
244 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.397522  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3512  hypothetical protein  23.98 
 
 
229 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1099  SapC family protein  23.61 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.693688  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2386  SapC family protein  23.74 
 
 
264 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3022  SapC family protein  24.66 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0318248  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3681  SapC  24.42 
 
 
258 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1114  SapC family protein  25.23 
 
 
239 aa  53.1  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3218  SapC family protein  23.79 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0655  SapC family protein  23 
 
 
237 aa  52  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1137  SapC family protein  23.79 
 
 
234 aa  52  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134042  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1077  SapC family protein  23.79 
 
 
234 aa  51.6  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0240  hypothetical protein  21.26 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1178  SapC family protein  22.55 
 
 
240 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.701461  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1211  SapC family protein  22.13 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.552472  normal  0.532412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0305  SapC family protein  24.07 
 
 
255 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2392  SapC related protein  22.94 
 
 
241 aa  48.5  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276727 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1851  SapC family protein  21.65 
 
 
242 aa  48.9  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.755163 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0084  SapC family protein  22.12 
 
 
273 aa  48.1  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3347  SapC family protein  21.19 
 
 
255 aa  47.8  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.652681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4287  SapC  19.83 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2701  SapC  27.04 
 
 
236 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0135847  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3179  SapC family protein  22.08 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0187288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0596  SapC family protein  23.38 
 
 
261 aa  45.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347217 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03269  SapC  22.38 
 
 
256 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1142  SapC family protein  21.12 
 
 
240 aa  45.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1173  SapC family protein  21.46 
 
 
228 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282711  normal  0.903795 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1123  SapC family protein  21.65 
 
 
240 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2830  SapC related protein  24.66 
 
 
242 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525847  hitchhiker  0.000912858 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0580  SapC family protein  22.48 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.132466 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03901  SapC related protein  25.51 
 
 
244 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3054  hypothetical protein  20.95 
 
 
236 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>