More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1181 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1181  glycosyltransferase, group 1 family protein  100 
 
 		 579 aa  1205    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0126  glycosyl transferase group 1  34.57 
 
 		 543 aa  309  8e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 756 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1511  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 382 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4075  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 744 aa  99  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4074  glycosyl transferase, group 1  25.79 
 
 		 773 aa  94.4  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  23.42 
 
 		 478 aa  87.8  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4094  glycosyl transferase, group 1  24.2 
 
 		 468 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.537371  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6505  Glycosyltransferase-like protein  38.46 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  30.53 
 
 		 496 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  29.51 
 
 		 370 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  30.53 
 
 		 496 aa  60.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1780  glycosyl transferase group 1  29.7 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  22.07 
 
 		 1177 aa  58.9  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1497  glycosyl transferase, group 1  23.12 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.949751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  29.34 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 468 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 371 aa  57.8  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  22.4 
 
 		 1177 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.25 
 
 		 377 aa  57  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 348 aa  57  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  26.47 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  26.96 
 
 		 350 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1470  mannosyl transferase  29.31 
 
 		 350 aa  56.6  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000263764  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2196  group 1 glycosyl transferase  35.54 
 
 		 391 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.844277 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0459  glycosytransferase, putative  26.07 
 
 		 350 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00630871  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 396 aa  56.2  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1498  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 		 350 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1684  glycosyltransferase  28.45 
 
 		 350 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0854  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 		 404 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0579816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003534  glycosyltransferase  31.5 
 
 		 356 aa  55.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 362 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4076  ABC transporter permease  26.35 
 
 		 503 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0493942  normal  0.0623756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 400 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3693  glycosyltransferase  26.96 
 
 		 350 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  26.77 
 
 		 388 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  26.77 
 
 		 388 aa  54.7  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  25.35 
 
 		 429 aa  54.3  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  30.58 
 
 		 362 aa  54.3  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0080  hypothetical protein  23.03 
 
 		 513 aa  53.9  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2329  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 390 aa  53.9  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  27.83 
 
 		 391 aa  53.9  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0994  glycosyl transferase, group 1  26.54 
 
 		 471 aa  53.9  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.25386  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0591  glycosyl transferase, group 1  30.85 
 
 		 373 aa  53.9  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.42077 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0305  putative glycosyl transferase  26.21 
 
 		 329 aa  53.9  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3093  glycosyl transferase group 1  31.62 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2981  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 		 570 aa  53.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.791461  normal  0.930626 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 395 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 379 aa  52.8  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.31 
 
 		 407 aa  52.8  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3925  group 1 glycosyl transferase  24.47 
 
 		 421 aa  52.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  23.53 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 385 aa  52.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1231  glycosyl transferase group 1  26.56 
 
 		 372 aa  52.4  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 		 373 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  31.62 
 
 		 448 aa  52  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  24.49 
 
 		 368 aa  52  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  24.1 
 
 		 822 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2458  glycosyl transferase family protein  28.19 
 
 		 774 aa  52  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.745195  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  23.53 
 
 		 388 aa  52  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2541  group 1 glycosyl transferase  28.93 
 
 		 382 aa  51.6  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.433843  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  26.16 
 
 		 482 aa  51.2  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1131  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 357 aa  51.2  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2385  glycosyl transferase group 1  25.7 
 
 		 385 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1130  glycosyl transferase group 1  28.23 
 
 		 357 aa  50.8  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2830  glycosyl transferase group 1  27.69 
 
 		 380 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0420061 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0081  hypothetical protein  25.77 
 
 		 500 aa  50.8  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4707  glycosyl transferase group 1  22.94 
 
 		 378 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.103608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  27.68 
 
 		 363 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1744  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 343 aa  50.8  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 		 365 aa  50.4  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  31.3 
 
 		 389 aa  50.4  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3099  glycosyl transferase group 1  27.88 
 
 		 358 aa  50.4  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  29.31 
 
 		 377 aa  50.4  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5586  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.45 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0028  LPS glycosyltransferase  28.07 
 
 		 373 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000218534  hitchhiker  0.00835571 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37583  predicted protein  29.86 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.17568  hitchhiker  0.00128126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5634  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.45 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  25 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0132  glycosyl transferase group 1  35.24 
 
 		 359 aa  48.9  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00903136  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5063  glycosyl transferase group 1  26.45 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1998  glycosyl transferase group 1  24.62 
 
 		 379 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.82 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3397  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 381 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0479669  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  23.86 
 
 		 391 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1969  glycosyl transferase, group 1  25.22 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0847946 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0846  glycosyltransferase-like protein  25.4 
 
 		 392 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 390 aa  49.3  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  22.16 
 
 		 395 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 406 aa  48.9  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2436  glycosyl transferase group 1  25.14 
 
 		 385 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0413  glycosyl transferase, group 1  22.92 
 
 		 386 aa  49.3  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.818994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 		 424 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1723  glycosyl transferase, group 1  26.99 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.952593  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 		 369 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3201  glycosyl transferase group 1  24.8 
 
 		 505 aa  48.5  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2970  putative lipopolysaccharide N- acetylglucosaminyltransferase  27.01 
 
 		 550 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.602984  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>