More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0338 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1046  ABC transporter ATPase  68.35 
 
 		 758 aa  1042    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0338  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 704 aa  1436    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0736  ABC transporter related  44.49 
 
 		 630 aa  578  1e-164  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2744  ABC transporter related  62.95 
 
 		 609 aa  399  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15000  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  63.25 
 
 		 600 aa  385  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0302703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08180  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  62.41 
 
 		 632 aa  379  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.195035 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1521  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 601 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0493324  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2722  ABC transporter related protein  52.2 
 
 		 631 aa  375  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2978  ABC transporter related  59.27 
 
 		 596 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.013676  decreased coverage  0.00456661 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3302  ABC transporter-related protein  58.19 
 
 		 606 aa  355  1e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13340  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  55.15 
 
 		 630 aa  353  5.9999999999999994e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0691975  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3225  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 377 aa  353  8e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.704476  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1950  ABC transporter related  58.17 
 
 		 615 aa  353  8e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.975434 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1047  ABC transporter related  58.22 
 
 		 606 aa  346  7e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1285  ABC transporter related  55.08 
 
 		 610 aa  346  8.999999999999999e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000856042 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  56.4 
 
 		 613 aa  343  9e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0302406  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11685  macrolide ABC transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 591 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.819157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1215  ABC transporter related  55.82 
 
 		 608 aa  342  2e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.207938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3854  ABC transporter related  56.64 
 
 		 611 aa  335  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.53962  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30250  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  57.6 
 
 		 572 aa  326  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0865  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 608 aa  309  9e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.380755  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3518  ABC transporter related  55.44 
 
 		 587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284469  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0977  ABC transporter related  54.45 
 
 		 616 aa  308  3e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.126442  hitchhiker  0.00329401 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2963  ABC transporter related  52.63 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.616286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3007  ABC transporter related  52.63 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333265  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0513  ABC transporter related protein  53.4 
 
 		 592 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3161  ABC transporter-like protein  54.27 
 
 		 608 aa  300  5e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.970833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0409  ABC transporter, ATP-binding subunit  52.26 
 
 		 596 aa  296  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.722245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8452  ABC transporter related  52.04 
 
 		 608 aa  296  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.030329  decreased coverage  0.00000193115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3959  ABC transporter related  50.16 
 
 		 612 aa  293  1e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.143764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0650  ABC transporter related  50.86 
 
 		 590 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0493  ABC transporter related protein  51.35 
 
 		 602 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0784  ABC transporter related  53.08 
 
 		 598 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3996  ABC transporter related protein  55.05 
 
 		 592 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.181167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0990  ABC transporter related protein  52.25 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0728  ABC transporter related  52.05 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3947  ABC transporter related protein  48.23 
 
 		 601 aa  276  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0772  ABC transporter related  49.35 
 
 		 632 aa  270  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03410  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  50.34 
 
 		 628 aa  269  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8616  ABC transporter ATP-binding protein  51.57 
 
 		 602 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4554  ABC transporter related  45.29 
 
 		 617 aa  257  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32430  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  49.16 
 
 		 600 aa  251  3e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.775156  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06770  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain protein  27.81 
 
 		 668 aa  223  8e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.00000102079  normal  0.871828 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1384  ABC transporter related protein  29.3 
 
 		 557 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3620  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 		 557 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.914588  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3615  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 		 557 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3688  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.68 
 
 		 557 aa  214  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2190  ABC transporter, ATP-binding protein  36.66 
 
 		 631 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.783831 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30493  ABC(ATP-binding) family transporter  28.16 
 
 		 723 aa  212  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.658611 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  28.64 
 
 		 647 aa  210  6e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2000  ABC transporter related  36.07 
 
 		 631 aa  210  9e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000123424  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1814  ABC transporter related  35.26 
 
 		 639 aa  209  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2173  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 631 aa  208  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0718  ABC transporter related  38.27 
 
 		 626 aa  207  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.332523  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2308  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 631 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000184058  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2010  ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 631 aa  207  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000675061  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2164  ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 631 aa  207  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00326588  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3145  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 631 aa  207  7e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000568363  normal  0.0176571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2225  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 631 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1982  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 631 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000663544  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1964  ABC transporter, ATP-binding protein  36.07 
 
 		 631 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386922  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0780  ATPase  35.94 
 
 		 630 aa  206  1e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.989868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2351  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.91 
 
 		 559 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14070  ABC transporter related  26.24 
 
 		 640 aa  204  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0328486  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2312  ABC transporter related  37.11 
 
 		 642 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3463  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.38 
 
 		 550 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.427951  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0375  ATPase  35.92 
 
 		 631 aa  200  7.999999999999999e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2553  ABC transporter ATPase  36.78 
 
 		 642 aa  200  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  27.7 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2364  ABC transporter related  37.99 
 
 		 642 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.217741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2868  ABC transporter, ATP-binding protein  36.47 
 
 		 642 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.914914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3230  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 228 aa  199  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3220  ABC transporter related  37.07 
 
 		 653 aa  198  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000221597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0768  ABC transporter related  34.23 
 
 		 636 aa  197  5.000000000000001e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0750  ABC transporter related  28.15 
 
 		 537 aa  197  5.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1613  ABC transporter-related protein  35.95 
 
 		 630 aa  197  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000050504  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1447  ABC transporter related  36.5 
 
 		 632 aa  197  8.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  25.31 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1935  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.55 
 
 		 550 aa  196  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.461584  normal  0.714392 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4068  ABC transporter related  33.33 
 
 		 630 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000802504  hitchhiker  0.000858095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2211  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.55 
 
 		 550 aa  196  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.670605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2911  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.5 
 
 		 550 aa  195  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.608005  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1500  ABC transporter related  35.78 
 
 		 630 aa  195  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.384495  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1040  ABC transporter-related protein  37.69 
 
 		 629 aa  194  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  27.06 
 
 		 645 aa  194  5e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11760  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.31 
 
 		 558 aa  194  5e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.406602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1571  ABC transporter related  35.59 
 
 		 631 aa  193  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.459004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0299  ABC transporter related  36.45 
 
 		 642 aa  192  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1278  ABC transporter ATPase  35.35 
 
 		 625 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.760109  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  35.74 
 
 		 613 aa  192  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07215  ABC transporter ATP-binding protein  34.23 
 
 		 622 aa  189  2e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09590  ATPase component of ABC transporters with duplicated ATPase domain  26.03 
 
 		 709 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000107882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1008  Fis family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 629 aa  188  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2573  ABC transporter, ATP-binding protein  27.15 
 
 		 542 aa  188  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.160568  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1823  ABC transporter related  35.38 
 
 		 632 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00644209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4406  ABC transporter related protein  33.75 
 
 		 630 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1381  ATPase  36.62 
 
 		 641 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.981261  normal  0.290816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2617  ABC transporter, ATP-binding protein  26.53 
 
 		 548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000147161 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  27.08 
 
 		 641 aa  185  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1799  putative ABC transporter ATP-binding protein  28.17 
 
 		 554 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.255837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>