44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1029 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1029  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1163    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0165  hypothetical protein  26.73 
 
 		 595 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.820724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2874  hypothetical protein  31.53 
 
 		 555 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2979  hypothetical protein  39.58 
 
 		 464 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.213619  normal  0.0308944 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3220  hypothetical protein  35.15 
 
 		 429 aa  98.2  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.309685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3739  hypothetical protein  27.36 
 
 		 428 aa  98.2  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.459045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3692  hypothetical protein  39.85 
 
 		 466 aa  93.6  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24021  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0828  hypothetical protein  40.6 
 
 		 465 aa  93.6  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.169587  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2733  hypothetical protein  28.52 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0286809  normal  0.420711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1535  hypothetical protein  38.81 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1691  SMC domain protein  32.96 
 
 		 378 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0172  hypothetical protein  33.33 
 
 		 527 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.707378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1311  hypothetical protein  32.3 
 
 		 508 aa  80.9  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.139269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0116  hypothetical protein  42.2 
 
 		 617 aa  80.5  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000168876  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1873  hypothetical protein  33.82 
 
 		 408 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3580  hypothetical protein  34.44 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00103089  normal  0.191716 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4311  hypothetical protein  32.64 
 
 		 514 aa  68.2  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0701408  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl296  hypothetical protein  28.08 
 
 		 483 aa  66.6  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250959  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2287  hypothetical protein  38.64 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.125629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1798  hypothetical protein  34.56 
 
 		 478 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01780  hypothetical protein  29.05 
 
 		 378 aa  63.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1770  hypothetical protein  34.56 
 
 		 459 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2063  hypothetical protein  34.62 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731281  normal  0.359849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2027  hypothetical protein  34.87 
 
 		 435 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.34457  normal  0.0634811 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1027  hypothetical protein  33.33 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2955  hypothetical protein  28.75 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3408  putative ATP-dependent endonuclease (OLD family protein)  33.33 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0529287 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0707  hypothetical protein  30.37 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.852427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4715  hypothetical protein  36.26 
 
 		 255 aa  54.3  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.214433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2371  hypothetical protein  29.1 
 
 		 369 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0136  hypothetical protein  31.34 
 
 		 224 aa  54.3  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224631  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0165  hypothetical protein  32.08 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2422  hypothetical protein  28.33 
 
 		 442 aa  49.7  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  32.58 
 
 		 566 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3548  hypothetical protein  31.34 
 
 		 368 aa  48.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001831  hypothetical protein  26.53 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1460  hypothetical protein  26.81 
 
 		 391 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2659  ATP-dependent OLD family endonuclease  34.85 
 
 		 548 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0191795  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0764  hypothetical protein  26.15 
 
 		 371 aa  44.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.71 
 
 		 677 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  35.71 
 
 		 677 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25506  predicted protein  43.18 
 
 		 1237 aa  44.3  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  42.86 
 
 		 1141 aa  43.9  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4093  SMC domain protein  36.59 
 
 		 454 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  0.0462835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>