130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3185 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_3185  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
335 aa  645    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2093  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  53.95 
 
 
310 aa  269  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.124836  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5153  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  51.7 
 
 
286 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  decreased coverage  0.000104531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1363  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  53.67 
 
 
292 aa  253  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.698598  normal  0.399263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50 
 
 
342 aa  252  6e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6125  Lauroyl/myristoyl acyltransferase-like protein  48.3 
 
 
304 aa  249  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.226979  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  48.31 
 
 
304 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2245  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.35 
 
 
307 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2292  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.35 
 
 
307 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2284  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.35 
 
 
307 aa  241  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2073  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.94 
 
 
320 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.343733  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1787  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50 
 
 
310 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  50.17 
 
 
314 aa  238  8e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3835  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  48.62 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0338781 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0820  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.55 
 
 
404 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0772166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1774  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  49.32 
 
 
310 aa  233  3e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0198812 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14960  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.59 
 
 
307 aa  232  7.000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12630  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  48.7 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2406  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.47 
 
 
300 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1922  lipid A biosynthesis acyltransferase  46.88 
 
 
303 aa  216  5e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2344  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  42.96 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2102  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.42 
 
 
307 aa  203  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.995802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2290  lipid A biosynthesis acyltransferase  47.06 
 
 
319 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.146974  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1354  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  47.26 
 
 
328 aa  185  8e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.499374  normal  0.216227 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.82 
 
 
337 aa  172  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  42.67 
 
 
311 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1659  lipid A biosynthesis acyltransferase  38.59 
 
 
326 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1982  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  38.22 
 
 
328 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.859869  hitchhiker  0.00608029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17440  Lauroyl/myristoyl acyltransferase  36.05 
 
 
317 aa  143  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0985707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.97 
 
 
318 aa  129  8.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.015073  normal  0.0495173 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1224  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.49 
 
 
234 aa  109  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.61 
 
 
290 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  29.41 
 
 
307 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.41 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.76 
 
 
307 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.86 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  28.74 
 
 
299 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.48 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.74 
 
 
302 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25 
 
 
289 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.53 
 
 
302 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.46 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3368  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.02 
 
 
288 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00130747  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 
324 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.63 
 
 
318 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.73 
 
 
298 aa  60.1  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.97 
 
 
331 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.03 
 
 
303 aa  59.7  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.69 
 
 
281 aa  59.3  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.61 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.66 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  21.96 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  22.87 
 
 
278 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  21.96 
 
 
281 aa  58.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.66 
 
 
298 aa  57.4  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.11 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  23.27 
 
 
307 aa  57.4  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  26 
 
 
303 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  28.42 
 
 
297 aa  56.2  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.46 
 
 
284 aa  55.8  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  24.02 
 
 
306 aa  55.5  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  25.1 
 
 
304 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.05 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5430  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.69 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1008  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.55 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2228  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.57 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.53 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.74 
 
 
284 aa  54.3  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.14 
 
 
286 aa  53.9  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4089  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.1 
 
 
326 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.230005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.05 
 
 
319 aa  53.5  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  18.97 
 
 
294 aa  53.1  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1946  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.73 
 
 
300 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.93 
 
 
306 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0079  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.15 
 
 
293 aa  52.8  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0319084 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0661  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.56 
 
 
282 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0888578  hitchhiker  0.00380684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3574  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  31.84 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.013317  normal  0.967772 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.05 
 
 
295 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2085  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.05 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.906755 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0962  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.33 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1676  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  18.84 
 
 
296 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.480087  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3056  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.42 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.605153 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  19.18 
 
 
295 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  28.72 
 
 
308 aa  50.4  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.54 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.36 
 
 
300 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.76 
 
 
297 aa  49.3  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  30.88 
 
 
295 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.94 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2375  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.67 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.83 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2112  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.53 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113083  normal  0.0192779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3358  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.7 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0237735 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.57 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1273  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.55 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.254537  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0990  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.19 
 
 
335 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00210235  unclonable  0.000000000756062 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.18 
 
 
295 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5603  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.1 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.865729  normal  0.897415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.88 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1242  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.27 
 
 
310 aa  47.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>