More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3115 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3115  histidine kinase  100 
 
 		 483 aa  926    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2146  putative signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 		 467 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00275148  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2866  histidine kinase  30.8 
 
 		 469 aa  149  9e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1114  histidine kinase  32.22 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0404541  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4531  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 516 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2634  ATPase domain-containing protein  29.89 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 662 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 658 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  38.46 
 
 		 662 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 381 aa  104  4e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  36.21 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  36.21 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  38.39 
 
 		 640 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  32.16 
 
 		 515 aa  100  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 403 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 399 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 546 aa  99  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 1168 aa  97.8  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 480 aa  97.1  7e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  34.13 
 
 		 481 aa  96.7  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  38.92 
 
 		 397 aa  96.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0126  sensory box histidine kinase/response regulator  31.94 
 
 		 619 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.799989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  32.82 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  33.33 
 
 		 403 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 485 aa  95.1  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1596  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 385 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430448 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1550  sensory box histidine kinase  31.94 
 
 		 680 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1633  sensory box histidine kinase  32.44 
 
 		 680 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736823  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2882  two-component hybrid sensor and regulator  33.63 
 
 		 740 aa  95.1  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1405  sensor histidine kinase  28.15 
 
 		 483 aa  94  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 398 aa  94  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.29297  normal  0.836482 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1248  sensory box histidine kinase/response regulator  31.09 
 
 		 687 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.535727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 748 aa  94  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  35.04 
 
 		 459 aa  94  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1485  two-component hybrid sensor and regulator  32.75 
 
 		 575 aa  93.2  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1352  putative membrane sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 575 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 408 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00145033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1345  putative membrane sensor histidine kinase  32.75 
 
 		 575 aa  93.2  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  32.39 
 
 		 282 aa  92.8  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 682 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  31.33 
 
 		 413 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.26 
 
 		 564 aa  91.7  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0582  signal transduction histidine kinase-like protein  35.11 
 
 		 394 aa  91.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 		 748 aa  90.9  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1372  sensor histidine kinase  29.87 
 
 		 377 aa  90.9  5e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 665 aa  90.1  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163996  normal  0.752378 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 700 aa  90.1  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0906  sensor histidine kinase  31.86 
 
 		 469 aa  89.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0178022  hitchhiker  0.0000002134 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 386 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 561 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  33.64 
 
 		 467 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 725 aa  89.7  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 401 aa  89  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 671 aa  89  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.773791  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  31.76 
 
 		 683 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  30.5 
 
 		 523 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4515  two-component regulatory system sensory histidine kinase  30.45 
 
 		 383 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0377261  normal  0.0581519 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  26.36 
 
 		 366 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4063  histidine kinase  31.86 
 
 		 249 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0775473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 417 aa  87.4  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  34.74 
 
 		 356 aa  87.4  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  30.03 
 
 		 1226 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 640 aa  87  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 535 aa  87.4  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6398  histidine kinase  34.11 
 
 		 461 aa  87  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.176497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  31.22 
 
 		 309 aa  87  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 576 aa  86.7  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 344 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.140942  normal  0.159095 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4619  PAS  33.81 
 
 		 670 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4427  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 359 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.19 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5349  two-component sensor histidine kinase  34.05 
 
 		 452 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0266421 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 770 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 603 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  29.55 
 
 		 482 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  33.8 
 
 		 1101 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  28.28 
 
 		 518 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0559  sensory box histidine kinase  32.17 
 
 		 671 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 682 aa  85.5  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3522  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 477 aa  85.5  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  31.6 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 795 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 459 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5264  two-component sensor protein, C-terminus  31.71 
 
 		 193 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 		 523 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0384  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 574 aa  84.7  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  29.74 
 
 		 357 aa  85.1  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 594 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>