More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0864 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0864  Cytosine deaminase  100 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00990  cytosine/adenosine deaminase  73.15 
 
 		 175 aa  224  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2556  cytosine deaminase  65.07 
 
 		 149 aa  191  3e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.285237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1435  Cytosine deaminase  63.89 
 
 		 153 aa  189  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.317365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  61.81 
 
 		 145 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3776  cytosine deaminase  59.42 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.650074  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4144  cytosine deaminase  63.7 
 
 		 154 aa  184  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1480  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  62.04 
 
 		 145 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1602  cytosine deaminase  57.97 
 
 		 145 aa  178  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.574395  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1980  cytosine deaminase  59.72 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.597926  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1635  cytosine deaminase  52.41 
 
 		 145 aa  173  8e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.503034  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3869  cytosine deaminase  52.41 
 
 		 145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0725206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2506  cytosine deaminase  55.63 
 
 		 149 aa  170  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0043356  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0907  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  56.64 
 
 		 146 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.459324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1307  cytosine deaminase  57.75 
 
 		 145 aa  168  3e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4158  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  54.67 
 
 		 160 aa  167  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0945  cytosine deaminase  51.27 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.353729  normal  0.610423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1397  cytosine deaminase  52.41 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78481  cytosine deaminase  54.42 
 
 		 150 aa  164  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.701177  normal  0.798696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1786  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.45 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.315123  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0051  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  47.48 
 
 		 146 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1483  Cytosine deaminase  52.78 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1204  cytosine deaminase  52.41 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2798  cytosine deaminase  51.72 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0117  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.45 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.515188 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1290  Cytosine deaminase  50.34 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.589706 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3086  cytosine deaminase  50.34 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2881  cytosine deaminase  51.72 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2977  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  51.72 
 
 		 145 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3077  cytosine deaminase  50 
 
 		 145 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3229  cytosine deaminase  50.34 
 
 		 145 aa  160  9e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0677  cytosine deaminase  51.45 
 
 		 145 aa  159  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5742  Cytosine deaminase  47.1 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1318  hypothetical protein  46.76 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0892  cytosine deaminase  52.31 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0179  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  51.13 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0485  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.58 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1204  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.55 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0498  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.58 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0144132 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2066  Cytosine deaminase  49.31 
 
 		 165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2973  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.8 
 
 		 274 aa  128  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1816  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.69 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.468453  normal  0.80703 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2579  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  46.85 
 
 		 146 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05950  cytosine deaminase, putative  43.15 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275444  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3461  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  46.85 
 
 		 150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1414  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.3 
 
 		 143 aa  126  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4055  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  44.76 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1123  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.46 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4937  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  39.31 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0889323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5409  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.83 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.210093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3674  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.07 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.411203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3606  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.07 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241267  normal  0.539559 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3601  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  45.07 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00422327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04267  cytosine deaminase  43.15 
 
 		 151 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.205672  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0824  cytosine deaminase  45.65 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.385917  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1451  putative hydrolase protein  35.34 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.849244 
 
 
-
 
NC_002620  TC0232  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0819594  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0581  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.39 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.679154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3121  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1331  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.06 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.324375 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0595  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.39 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1396  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.06 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.355926  normal  0.109007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4941  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.18 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  30.94 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1562  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.19 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0968895  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0204  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.938161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0015  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  41.84 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2773  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.43 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.04 
 
 		 150 aa  67  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0014  tRNA-adenosine deaminase  34.69 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000574394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1413  tRNA-adenosine deaminase  37.89 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1080  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.87 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1686  hypothetical protein  40.95 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1685  hypothetical protein  40.95 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5352  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  34.04 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0501  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  32.98 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  27.86 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2352  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  34.39 
 
 		 190 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.496749  normal  0.790944 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5296  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  37.62 
 
 		 166 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000172102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2982  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.13 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1229  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.29 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1614  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  31.82 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0790384  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0018  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.37 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000222669  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0274  tRNA-adenosine deaminase  34.31 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1139  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  34.75 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.414141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1271  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.45 
 
 		 177 aa  62  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000483662  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1573  tRNA-adenosine deaminase  32.14 
 
 		 189 aa  62  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.809393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3563  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.89 
 
 		 166 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1381  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.87 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.366116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1065  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.67 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0616301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0022  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain protein  36.63 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.21 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1315  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.79 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.847285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3140  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.45 
 
 		 175 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3629  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.89 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2843  tRNA-specific adenosine deaminase  33.61 
 
 		 178 aa  60.5  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3793  tRNA-specific adenosine deaminase  37.11 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0017  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.387948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1118  tRNA-specific adenosine deaminase  37.11 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>