49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2009 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  100 
 
 		 459 aa  929    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  22.15 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  24.08 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  24.66 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  21.15 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  20.72 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0802  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 470 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  21.46 
 
 		 431 aa  55.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1394  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 399 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0739482 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  21.76 
 
 		 540 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  22.47 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  22.65 
 
 		 501 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  21.84 
 
 		 474 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  26.8 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  24.39 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  26.8 
 
 		 404 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  25 
 
 		 454 aa  47  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13033  O-antigen polymerase (wzy)  35.37 
 
 		 390 aa  47  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  26.14 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  26.14 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  26.14 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  26.14 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  24.53 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  18.27 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0465  O-antigen polymerase  28.85 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.216322  normal  0.610525 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  20.75 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1540  hypothetical protein  27.5 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  22 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  20.37 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 422 aa  45.1  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  31.73 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  24.28 
 
 		 686 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  24.28 
 
 		 686 aa  44.3  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  25.15 
 
 		 336 aa  44.3  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  21.63 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  25.23 
 
 		 412 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  22.56 
 
 		 440 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  24.73 
 
 		 428 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0144  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0149  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 388 aa  43.5  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  25.91 
 
 		 440 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  20.73 
 
 		 459 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  22.32 
 
 		 428 aa  43.5  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1123  O-antigen polymerase  26.24 
 
 		 442 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.801174  normal  0.617722 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  22.01 
 
 		 474 aa  43.5  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  25.83 
 
 		 466 aa  43.1  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  24.04 
 
 		 425 aa  43.1  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>