12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0465 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0465  O-antigen polymerase  100 
 
 		 486 aa  974    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.216322  normal  0.610525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  51.92 
 
 		 474 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0802  O-antigen polymerase  43.59 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  26.47 
 
 		 464 aa  50.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.55 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  25.26 
 
 		 428 aa  47  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  20.81 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  23.89 
 
 		 540 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  30.17 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0156  O-antigen polymerase  25.38 
 
 		 390 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  25.97 
 
 		 512 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0421  O-antigen polymerase  29.58 
 
 		 443 aa  43.5  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>