11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0802 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0802  O-antigen polymerase  100 
 
 
470 aa  921    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0465  O-antigen polymerase  43.38 
 
 
486 aa  359  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.216322  normal  0.610525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4235  O-antigen polymerase  45.31 
 
 
474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000407687  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  24.86 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  28.16 
 
 
428 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  27.5 
 
 
465 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  27.83 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0679  O-antigen polymerase  22.97 
 
 
437 aa  44.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  24.75 
 
 
436 aa  44.3  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2333  O-antigen polymerase  25.44 
 
 
431 aa  43.9  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.964533  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3371  O-antigen polymerase  24.12 
 
 
413 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>