10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0156 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0156  O-antigen polymerase  100 
 
 		 390 aa  745    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  36.14 
 
 		 402 aa  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  28.82 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  26.23 
 
 		 389 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  25.33 
 
 		 457 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  29.65 
 
 		 509 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0465  O-antigen polymerase  28.44 
 
 		 486 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.216322  normal  0.610525 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  23.15 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.61 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  27.87 
 
 		 737 aa  42.7  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>