More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0795 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0795  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  71.89 
 
 
250 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3241  Methyltransferase type 11  56.22 
 
 
255 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.924644  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3140  Methyltransferase type 11  56.22 
 
 
255 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3042  methyltransferase type 11  55.92 
 
 
254 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.112439  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48660  Methyltransferase type 11 protein  54.66 
 
 
254 aa  268  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302894  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3953  methyltransferase type 11  54.22 
 
 
250 aa  266  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29470  hypothetical protein  52.21 
 
 
250 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2169  hypothetical protein  51.02 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0210043 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1167  methyltransferase type 11  51.01 
 
 
256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6503  Methyltransferase type 11  49.61 
 
 
255 aa  239  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0410  Methyltransferase type 11  44.31 
 
 
264 aa  239  4e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.371089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4501  methyltransferase type 11  51.23 
 
 
249 aa  236  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.162908 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0445  Methyltransferase type 11  44.13 
 
 
252 aa  234  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00103969  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1748  hypothetical protein  45.12 
 
 
253 aa  231  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0563  Methyltransferase type 11  46.8 
 
 
253 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.267542  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0048  Methyltransferase type 11  44.94 
 
 
269 aa  217  2e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0132  Methyltransferase type 11  47.97 
 
 
256 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3369  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 
256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.209889  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2733  Methyltransferase type 11  38.58 
 
 
256 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4526  methyltransferase type 11  44.67 
 
 
253 aa  198  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3133  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
246 aa  192  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.998668  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13690  putative methyltransferase  43.21 
 
 
249 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.784995  normal  0.84173 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1226  hypothetical protein  41.56 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3007  methyltransferase type 11  36.82 
 
 
246 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.036599  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2287  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
250 aa  171  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0455227 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08931  SAM-binding motif-containing protein  34.68 
 
 
255 aa  157  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0750  hypothetical protein  31.4 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3523  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0454  Methyltransferase type 11  42.59 
 
 
243 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.427949  normal  0.218232 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00330  trans-aconitate 3-methyltransferase, putative  32.26 
 
 
405 aa  82  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.10395  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  42.74 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0618  Methyltransferase type 11  39.53 
 
 
249 aa  78.6  0.00000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.269288  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1428  hypothetical protein  36.8 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.097485  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1169  methyltransferase  35.94 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.374772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  42.02 
 
 
242 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1188  hypothetical protein  35.94 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.304723  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1282  hypothetical protein  35.94 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.522123  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1167  methyltransferase  35.94 
 
 
251 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  26.47 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
254 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1362  hypothetical protein  35.94 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.40676e-29 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1206  methyltransferase type 11  40.83 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1223  methyltransferase type 11  40.83 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.762545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1233  methyltransferase type 11  40.83 
 
 
239 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1326  hypothetical protein  37.21 
 
 
251 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  38.76 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  39.84 
 
 
255 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  39.52 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
259 aa  71.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4134  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13375  methyltransferase  35.96 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.352692 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2657  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
259 aa  68.9  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  39.17 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1050  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00394704 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27240  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.52 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1533  Methyltransferase type 12  26.58 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295316  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1725  Methyltransferase type 11  40 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.873166  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  37.1 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  26.5 
 
 
260 aa  66.2  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  42.53 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0692  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52120  trans-aconitate methyltransferase 1  29.86 
 
 
310 aa  65.5  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  0.159026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  39.02 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  26.92 
 
 
318 aa  65.5  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2390  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000447535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3567  Methyltransferase type 11  38.81 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.197641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  34.71 
 
 
257 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0017  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 
254 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3418  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.268365  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6142  methyltransferase type 11  31.42 
 
 
261 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.338244  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  41.75 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
252 aa  60.1  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8355  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 
254 aa  58.9  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00809  hypothetical protein  37.7 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.721636  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6308  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
263 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  39.06 
 
 
265 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0503  hypothetical protein  33.04 
 
 
278 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.61991  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0663  hypothetical protein  35.29 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.323405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07260  hypothetical protein  35.29 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2192  methyltransferase type 11  26.7 
 
 
279 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2996  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
273 aa  55.8  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  40.14 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  27 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  41.67 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
233 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  36.15 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2174  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
276 aa  53.9  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0827328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  37.36 
 
 
268 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 
284 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1760  type 11 methyltransferase  33.83 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0383  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
277 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
256 aa  53.9  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>