222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0115 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0115  patatin  100 
 
 		 285 aa  580  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0045028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0310  hypothetical protein  64.26 
 
 		 284 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.544129  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1912  patatin  45.79 
 
 		 282 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000188558  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01322  Patatin  34.71 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1205  patatin  33.96 
 
 		 279 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1021  Patatin  35.68 
 
 		 318 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000453292  normal  0.111336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1113  Patatin  35.21 
 
 		 318 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344867  normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  34.39 
 
 		 308 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2345  Patatin  26.39 
 
 		 294 aa  85.5  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1178  lipoprotein transmembrane  38.76 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0068369  normal  0.214637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  35.38 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2089  patatin  35.93 
 
 		 302 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0014749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2089  phospholipase, patatin family  27.59 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000554563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2070  phospholipase, putative  27.24 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00380586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1850  phospholipase  27.93 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1821  phospholipase  27.93 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0324858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1805  phospholipase  27.93 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.554079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1992  phospholipase  27.93 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.40976  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2026  phospholipase, patatin family  27.93 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.976629999999999e-49 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3038  putative exported phospholipase, patatin-like  34.29 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000229451  unclonable  0.00000199426 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  35.33 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  34.13 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2892  patatin  33.67 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.679989  normal  0.123114 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  33.33 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  33.33 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  33.33 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_002950  PG1879  hypothetical protein  22.09 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1232  patatin  32.98 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.288587  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2629  patatin-like phospholipase  32.52 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000046656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0062  hypothetical protein  38.56 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.968802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  35.33 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1601  patatin-like phospholipase  32.52 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00000189293  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2542  patatin family phospholipase  32.52 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0832269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2488  patatin family phospholipase  32.52 
 
 		 347 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00508161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  36.36 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  35.23 
 
 		 358 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1611  patatin  36.36 
 
 		 327 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000105595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2104  patatin-like phospholipase  33.53 
 
 		 347 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214716  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27530  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  27.39 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  32.52 
 
 		 250 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1983  patatin-like phospholipase  32.02 
 
 		 358 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00013559  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1219  patatin  32.78 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000227608  normal  0.293429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  30.62 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  34.1 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3335  phospholipase, patatin family  28.62 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000671246  hitchhiker  0.00000000000000577087 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1377  patatin-like phospholipase  31.82 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00276521  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1994  phospholipase, patatin family  28.28 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0248456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0228  Patatin  23.88 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1022  patatin-like phospholipase family protein  34.09 
 
 		 285 aa  72  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.128561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3209  patatin-like phospholipase  31.82 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000473323  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1641  putative exported phospholipase  33.53 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000163376  normal  0.216131 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1174  patatin  28.51 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0361  patatin  33.16 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  31.36 
 
 		 333 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2403  patatin  26.81 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  33.5 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  31.36 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  31.36 
 
 		 320 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  27.52 
 
 		 720 aa  68.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0660  Patatin  29.26 
 
 		 321 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.78646 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  33.12 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  30.99 
 
 		 728 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  31.92 
 
 		 727 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  32.54 
 
 		 310 aa  67  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  28.02 
 
 		 796 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  28.14 
 
 		 798 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  30.73 
 
 		 751 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1180  putative lipoprotein  32.91 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0293154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  30.73 
 
 		 728 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  30.99 
 
 		 728 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  30.57 
 
 		 777 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  29.82 
 
 		 728 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  34.38 
 
 		 900 aa  65.1  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  31.07 
 
 		 728 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  40.96 
 
 		 923 aa  63.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  31 
 
 		 707 aa  63.9  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  28.65 
 
 		 775 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3042  patatin  28.72 
 
 		 586 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  26.04 
 
 		 803 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  26.04 
 
 		 803 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  26.04 
 
 		 803 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  29.27 
 
 		 750 aa  62.4  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1250  Patatin  31.17 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2480  putative patatin phospholipase  28.96 
 
 		 357 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  27.59 
 
 		 748 aa  62.4  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  29.49 
 
 		 894 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2467  patatin  37.04 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223605  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2087  hypothetical protein  28.06 
 
 		 334 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  30.53 
 
 		 345 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  30.26 
 
 		 735 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  32.03 
 
 		 734 aa  60.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0303  patatin  27.27 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0052982  hitchhiker  0.00220393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2157  patatin  35.37 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0732494  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  43.24 
 
 		 981 aa  59.3  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.85 
 
 		 733 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  29.07 
 
 		 738 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1099  Patatin  29.89 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  29.76 
 
 		 804 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  24.24 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  28.28 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>