More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2662 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  100 
 
 		 281 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  66.06 
 
 		 291 aa  363  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  64.64 
 
 		 283 aa  362  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  63.7 
 
 		 283 aa  361  9e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  65.7 
 
 		 291 aa  359  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2239  lipoyl synthase  64.41 
 
 		 280 aa  359  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0380  lipoyl synthase  62.28 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3156  lipoyl synthase  55.84 
 
 		 289 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.135805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2940  lipoyl synthase  55.84 
 
 		 289 aa  305  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  54.64 
 
 		 283 aa  301  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  51.96 
 
 		 288 aa  298  7e-80  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  53.28 
 
 		 294 aa  298  7e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  55 
 
 		 296 aa  296  2e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0274  lipoyl synthase  55.43 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.99023 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  55.16 
 
 		 324 aa  294  9e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2200  lipoyl synthase  54.55 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.810557  normal  0.0342252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2570  lipoyl synthase  54.55 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4749  lipoyl synthase  54.38 
 
 		 306 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108215 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  51.07 
 
 		 300 aa  290  1e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  50.73 
 
 		 292 aa  291  1e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  52.19 
 
 		 291 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0242  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 332 aa  288  6e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0542  lipoyl synthase  51.82 
 
 		 297 aa  288  9e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  52.67 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  52.67 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 321 aa  287  1e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 314 aa  287  2e-76  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  51.46 
 
 		 282 aa  285  4e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3442  lipoyl synthase  50 
 
 		 336 aa  285  5e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.725492  normal  0.582796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0313  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 357 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 321 aa  285  7e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 321 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 321 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 321 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 321 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  52.31 
 
 		 321 aa  285  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  51.41 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  52.35 
 
 		 318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0298  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132518 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0293  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 326 aa  283  3.0000000000000004e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  52.22 
 
 		 291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0567  lipoic acid synthetase  50.36 
 
 		 289 aa  282  4.0000000000000003e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 306 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 321 aa  281  9e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0599  lipoyl synthase  50 
 
 		 373 aa  280  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0992056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3934  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 338 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.521126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  50.7 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0554  lipoyl synthase  50 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.86018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 304 aa  280  2e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  52.36 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 321 aa  279  3e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  51.08 
 
 		 288 aa  279  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5924  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 320 aa  278  5e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.848601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0362  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 332 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297178 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 321 aa  278  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  49.29 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16941  lipoyl synthase  51.44 
 
 		 297 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16371  lipoyl synthase  52.17 
 
 		 294 aa  276  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2696  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 320 aa  276  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4881  lipoyl synthase  48.59 
 
 		 327 aa  276  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  52.33 
 
 		 337 aa  276  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0628  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.931315  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1598  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0464  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.104715  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23551  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 294 aa  276  3e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.225624 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0444  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0316  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0479875  normal  0.0232399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0410  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0110  lipoyl synthase  54.29 
 
 		 322 aa  276  4e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  50.72 
 
 		 308 aa  275  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  49.12 
 
 		 319 aa  275  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0238  lipoyl synthase  47.54 
 
 		 294 aa  276  4e-73  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.39899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3492  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891871 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04289  lipoyl synthase  50 
 
 		 327 aa  275  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  51.26 
 
 		 321 aa  275  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 320 aa  275  7e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0386  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 329 aa  275  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86797  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0052  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1638  lipoyl synthase  51.72 
 
 		 299 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0218  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3186  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1375  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  46.98 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2799  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0788526  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>