More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0954 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 125 aa  244  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  79.84 
 
 		 129 aa  205  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  66.94 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  66.94 
 
 		 124 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  63.71 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  58.06 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  58.06 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  56.78 
 
 		 123 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 123 aa  95.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  42.59 
 
 		 228 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  45.38 
 
 		 124 aa  90.1  9e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  43.14 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  43.14 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  43.24 
 
 		 132 aa  88.6  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 		 128 aa  87  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.66 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  43.14 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.8 
 
 		 125 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.8 
 
 		 125 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  84.3  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  38.79 
 
 		 125 aa  83.6  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  43.59 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  37.93 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  43.27 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.13 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 		 126 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 132 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  36.29 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.5 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  36.94 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  40.31 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  38.74 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  34.86 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  36.72 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0908  CrcB protein  47.66 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.862739  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  43.12 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  39.09 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  45.12 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  38 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  36.8 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.28 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 123 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  43.02 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  35.19 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  42.71 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  45.16 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  38.52 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  37 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  40.22 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  42.16 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  35.48 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  41.9 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.1 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  38.66 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  41.38 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>