76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2147 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2147  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 283 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0794715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3379  TPR repeat-containing protein  38.05 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0201  tetratricopeptide domain-containing protein  32.11 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2752  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 556 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0761228  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36 
 
 		 373 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 361 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6666  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  47.95 
 
 		 839 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00671712  normal  0.283936 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 593 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 		 406 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  32.94 
 
 		 187 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.05 
 
 		 406 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 649 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  42.35 
 
 		 818 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  35.37 
 
 		 1421 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 		 286 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  42.19 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.82 
 
 		 1022 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 371 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 707 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.11 
 
 		 1056 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 738 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2286  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 		 291 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.441531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.74 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4974  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 422 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2075  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 292 aa  47  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.49 
 
 		 836 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1828  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 633 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0732208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  26.36 
 
 		 369 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  32.67 
 
 		 936 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  34.15 
 
 		 462 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2749  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 615 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 292 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.77 
 
 		 784 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  40 
 
 		 706 aa  46.2  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 280 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.16 
 
 		 988 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  34.57 
 
 		 233 aa  45.8  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 617 aa  45.8  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.62 
 
 		 542 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 297 aa  45.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  35.71 
 
 		 582 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 428 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  28.46 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 		 1240 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  24.07 
 
 		 820 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  37.36 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.54 
 
 		 458 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.35 
 
 		 219 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.97 
 
 		 1138 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 306 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 280 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 605 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  30.12 
 
 		 331 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.13 
 
 		 778 aa  43.9  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.93 
 
 		 189 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  34.62 
 
 		 539 aa  43.9  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0964  TPR domain-containing protein  29 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  31.1 
 
 		 591 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2555  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 728 aa  43.5  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  33 
 
 		 746 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.47 
 
 		 1056 aa  43.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  37.88 
 
 		 706 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0580  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.274085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.83 
 
 		 471 aa  42.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  32.1 
 
 		 581 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1029  peptidase aspartic, active site  37.37 
 
 		 654 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3497  TPR repeat-containing protein  36.9 
 
 		 178 aa  42.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0624  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 192 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0163  TPR repeat-containing protein  52.27 
 
 		 256 aa  42  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 174 aa  42  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>