245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1639 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1639  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 
695 aa  1296    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.830432  normal  0.388219 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0071  ComEC/Rec2-related protein  40.03 
 
 
697 aa  353  8e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  35.46 
 
 
739 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  36.69 
 
 
672 aa  245  3e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3179  ComEC/Rec2-related protein  32.58 
 
 
718 aa  224  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0397465  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  25.81 
 
 
720 aa  224  4.9999999999999996e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0831  ComEC/Rec2-related protein  37.26 
 
 
719 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00619984 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  35.83 
 
 
706 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  33.05 
 
 
757 aa  214  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  34.38 
 
 
726 aa  203  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  34.49 
 
 
684 aa  203  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  32.21 
 
 
671 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4498  putative ComEC/Rec2 family protein  32.9 
 
 
762 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  34.09 
 
 
684 aa  197  6e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  22.85 
 
 
674 aa  195  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1411  ComEC/Rec2-related protein  29.37 
 
 
792 aa  189  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.688241 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1842  ComEC/Rec2-related protein  30.8 
 
 
778 aa  187  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.818822  normal  0.518814 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2840  ComEC/Rec2-related protein  33.24 
 
 
764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.431764 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2044  ComEC/Rec2-related protein  31.45 
 
 
858 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1597  ComEC/Rec2-related protein  31.36 
 
 
810 aa  181  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2810  ComEC/Rec2-related protein  33.05 
 
 
764 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.553334  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2453  ComEC/Rec2-related protein  34.47 
 
 
774 aa  180  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.869804  normal  0.603908 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1804  putative competence protein  30.35 
 
 
694 aa  179  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.193881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3250  ComEC/Rec2-related protein  33.23 
 
 
755 aa  177  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1790  ComEC/Rec2-related protein  31.9 
 
 
754 aa  172  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0814214  hitchhiker  0.00430403 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0586  ComEC/Rec2-related protein  22.9 
 
 
672 aa  169  2e-40  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.330536  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  24.88 
 
 
757 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3718  ComEC/Rec2-related protein  31.29 
 
 
717 aa  159  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0627222 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4682  ComEC/Rec2-related protein  29.9 
 
 
752 aa  158  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.115227  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0648  ComEC/Rec2-related protein  31.75 
 
 
738 aa  158  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3214  ComEC/Rec2-related protein  35.71 
 
 
714 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_004310  BR1145  ComEC/Rec2 family protein, putative  28.59 
 
 
843 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2562  hypothetical protein  29.76 
 
 
1007 aa  152  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1522  ComEC/Rec2-related protein  32.16 
 
 
736 aa  151  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302052  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  33.55 
 
 
702 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1679  ComEC/Rec2-related protein  28.01 
 
 
779 aa  145  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  37.26 
 
 
760 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5224  ComEC/Rec2-related protein  31.4 
 
 
753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5147  ComEC/Rec2-related protein  29.87 
 
 
752 aa  142  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0358979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1644  ComEC/Rec2-related protein  30.88 
 
 
788 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1145  ComEC/Rec2-related protein  28.18 
 
 
799 aa  140  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2021  ComEC/Rec2-related protein  31.77 
 
 
760 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  20.41 
 
 
736 aa  134  6e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1711  ComEC/Rec2-related protein  32.63 
 
 
413 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0600  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.86 
 
 
815 aa  92.4  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.404851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0792  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26 
 
 
773 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92497  hitchhiker  0.0000000434572 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4445  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.21 
 
 
773 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0495736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1368  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.42 
 
 
770 aa  90.5  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2070  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.32 
 
 
818 aa  88.6  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0767  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.53 
 
 
840 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4176  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.15 
 
 
773 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2510  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.01 
 
 
794 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1483  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.16 
 
 
791 aa  85.5  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.23 
 
 
761 aa  84.3  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.93 
 
 
780 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1915  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.43 
 
 
798 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3098  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.63 
 
 
811 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0386  DNA uptake protein  29.17 
 
 
825 aa  79.3  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0606  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.98 
 
 
778 aa  79.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1164  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.56 
 
 
777 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00428726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4338  ComEC/Rec2-related protein  28.39 
 
 
798 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2093  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.92 
 
 
802 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.35183  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  20.95 
 
 
757 aa  78.2  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.79 
 
 
797 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.48 
 
 
759 aa  77.8  0.0000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4406  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.58 
 
 
773 aa  77.8  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0350  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.56 
 
 
822 aa  77.4  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1352  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.9 
 
 
948 aa  77.4  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0141053 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  30.98 
 
 
591 aa  76.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1343  ComEC/Rec2-related protein  28.77 
 
 
503 aa  76.3  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000547929 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  32.09 
 
 
835 aa  75.9  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0933  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.11 
 
 
861 aa  75.5  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.337545  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4458  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.69 
 
 
773 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00283851  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4071  DNA internalization-related competence protein  24.37 
 
 
773 aa  73.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.499181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2672  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.78 
 
 
784 aa  73.6  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1395  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.84 
 
 
799 aa  73.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.751306  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1205  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.37 
 
 
845 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.285892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1657  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.82 
 
 
771 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1806  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.49 
 
 
804 aa  72.4  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1379  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  31.3 
 
 
808 aa  72  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.011467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4223  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.37 
 
 
772 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.396559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4061  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.37 
 
 
773 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4551  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.37 
 
 
772 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.76471  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.81 
 
 
841 aa  70.9  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4347  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.37 
 
 
654 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000320337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3646  ComEC/Rec2-related protein  29.29 
 
 
493 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.75 
 
 
775 aa  70.1  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  24.58 
 
 
439 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0403  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.9 
 
 
878 aa  70.1  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.105029 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  25.61 
 
 
679 aa  69.7  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0663  hypothetical protein  22.38 
 
 
735 aa  69.7  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2506  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.32 
 
 
766 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3404  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.15 
 
 
747 aa  69.3  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.2 
 
 
851 aa  68.6  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.605949 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1779  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.23 
 
 
762 aa  68.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1465  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.85 
 
 
801 aa  68.2  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1593  ComEC/Rec2-related protein  23.68 
 
 
734 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0152523 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1043  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.79 
 
 
785 aa  68.2  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1920  ComEC/Rec2-related protein  25.24 
 
 
708 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.112953  normal  0.839642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1759  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  28.92 
 
 
814 aa  67.4  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0611654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>