More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1504 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1504  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  654    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.415101 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  45.03 
 
 		 343 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  47.93 
 
 		 342 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  44.71 
 
 		 341 aa  289  6e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  44.84 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1073  hypothetical protein  44 
 
 		 375 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.273172  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  45.32 
 
 		 343 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  43.27 
 
 		 343 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  45.86 
 
 		 343 aa  280  2e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  44.97 
 
 		 342 aa  279  4e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  44.71 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  44.12 
 
 		 341 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  43.44 
 
 		 343 aa  276  4e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  44.81 
 
 		 341 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  43.82 
 
 		 341 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  45.4 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  42.77 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3075  OmpA/MotB domain-containing protein  45.99 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.925956  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  40.94 
 
 		 342 aa  265  8e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  45.1 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  44.91 
 
 		 337 aa  258  1e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  41.85 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1710  OmpA/MotB domain-containing protein  44.54 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.590071  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  44.73 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3369  OmpA/MotB domain protein  41.49 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  40.29 
 
 		 345 aa  248  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  43.79 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  43.79 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  38.51 
 
 		 348 aa  241  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2831  OmpA/MotB domain-containing protein  39.72 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.227134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2098  OmpA/MotB domain-containing protein  41.62 
 
 		 338 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0859782  hitchhiker  0.000615141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2261  OmpA/MotB domain-containing protein  34.55 
 
 		 427 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2095  hypothetical protein  55 
 
 		 784 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2289  hypothetical protein  42.79 
 
 		 525 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0965  hypothetical protein  42.79 
 
 		 525 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.238986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1404  hypothetical protein  40.73 
 
 		 463 aa  181  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.356706 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2208  hypothetical protein  41.92 
 
 		 525 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.786447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  40.68 
 
 		 648 aa  172  5.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1040  hypothetical protein  44.28 
 
 		 799 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  45.13 
 
 		 249 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 256 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2932  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.14 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  37.9 
 
 		 179 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  39.29 
 
 		 263 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3897  OmpA/MotB domain-containing protein  35.83 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000323001  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2553  OmpA/MotB  27.27 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131644  hitchhiker  0.0000000000416757 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1685  OmpA/MotB domain protein  36.77 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0634  OmpA/MotB domain protein  32.85 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0267799  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0641  OmpA/MotB domain-containing protein  32.08 
 
 		 243 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149088  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1795  OmpA/MotB domain-containing protein  39.66 
 
 		 257 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0409  OmpA/MotB domain protein  37.98 
 
 		 271 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350229  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2018  OmpA/MotB domain-containing protein  38.64 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1587  OmpA/MotB  36.22 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000101337  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1341  flagellar motor protein MotS  29.72 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.146958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1013  chemotaxis MotB protein, putative  27.99 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.283691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2629  OmpA family outer membrane protein  27.09 
 
 		 323 aa  79.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16770  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 245 aa  79.7  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188615  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  38.26 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6481  OmpA/MotB domain protein  34 
 
 		 291 aa  78.2  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0579  OmpA/MotB domain protein  29.84 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4335  flagellar motor protein MotD  36.09 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492055  normal  0.417746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3439  OmpA/MotB domain protein  38.6 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1532  flagellar motor protein MotD  36.09 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254043  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1804  flagellar motor protein MotS  29.25 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.945658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1747  flagellar motor protein MotS  29.25 
 
 		 225 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3355  OmpA/MotB domain-containing protein  29.66 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3470  OmpA/MotB domain-containing protein  35.71 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  49.4 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2932  flagellar motor protein MotD  37.9 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  31.9 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0745  flagellar motor protein MotD  34.81 
 
 		 257 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4200  OmpA/MotB domain protein  37.93 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1545  flagellar motor protein MotS  28.3 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2870  OmpA/MotB domain protein  39.13 
 
 		 248 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1403  OmpA/MotB domain protein  31.29 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0436155  normal  0.643196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3904  flagellar motor protein MotD  37.72 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3617  OmpA/MotB domain-containing protein  36.5 
 
 		 228 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.238971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2076  OmpA/MotB domain-containing protein  39.68 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.645612  normal  0.358611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5470  OmpA/MotB domain-containing protein  36.5 
 
 		 228 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1985  motB protein  46.48 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1516  flagellar motor protein MotS  28.77 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1505  flagellar motor protein MotS  28.77 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231385  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0263  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1315  flagellar motor protein MotD  37.72 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1857  flagellar motor protein MotD  28.64 
 
 		 338 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3652  flagellar motor protein MotS  32.41 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1694  flagellar motor protein MotS  32.41 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1344  OmpA/MotB domain protein  29.38 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1540  flagellar motor protein MotS  28.77 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6702  OmpA/MotB domain protein  36.21 
 
 		 266 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0238  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3786  OmpA/MotB domain-containing protein  35.97 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125602  hitchhiker  0.0097659 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1726  flagellar motor protein MotS  28.77 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1659  flagellar motor protein MotS  28.77 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363446  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1084  OmpA/MotB domain protein  31.84 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1504  OmpA/MotB  35.34 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.877538  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1523  OmpA/MotB  34.53 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>