More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0920 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0920  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 281 aa  564  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0723  extracellular solute-binding protein  46.36 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.527134  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5603  extracellular solute-binding protein family 3  46.74 
 
 		 276 aa  236  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4454  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.160323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3990  extracellular solute-binding protein  29.18 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0601585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4082  extracellular solute-binding protein  28.45 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  25.1 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1231  extracellular solute-binding protein  25.98 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.62778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7701  extracellular solute-binding protein family 3  26.18 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  0.675112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  27.73 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0470  extracellular solute-binding protein  26.34 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6682  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.54 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5205  ABC transporter substrate binding protein  24.1 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1970  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1310  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  23.26 
 
 		 266 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1726  extracellular solute-binding protein family 3  23.26 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0106098  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2850  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5509  extracellular solute-binding protein family 3  28 
 
 		 277 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011689 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3265  extracellular solute-binding protein  26.27 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1775  extracellular solute-binding protein family 3  24.51 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.848081  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  24.55 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6020  extracellular solute-binding protein  27.16 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1930  extracellular solute-binding protein family 3  25.95 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000351018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3922  extracellular solute-binding protein family 3  28.57 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.0650452 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3326  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.36 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2697  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  26.69 
 
 		 517 aa  65.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0708  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.956063  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2002  extracellular solute-binding protein family 3  25.97 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167195  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1187  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.708736  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  22.87 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5578  extracellular solute-binding protein family 3  26.18 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1163  extracellular solute-binding protein  24.03 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.0605845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2287  extracellular solute-binding protein family 3  25.7 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000177355 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.78 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2254  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.41 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.164207  normal  0.105127 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1783  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.14 
 
 		 264 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  22.87 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.470206 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02234  histidine/lysine/arginine/ornithine transporter subunit  23.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1347  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212497  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  22.87 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  22.27 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5180  cystine ABC transporter, periplasmic cystine binding protein  22.61 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.71 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1729  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.71 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.133589  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0434  arginine-binding periplasmic protein 1  22.22 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2839  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.71 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2873  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.71 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223269  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  22.87 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2465  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  23.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1538  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2777  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  22.71 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262545  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2597  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  26.05 
 
 		 262 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144936  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02194  hypothetical protein  23.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0353  histidine ABC transporter periplasmic histidine-binding protein  22.22 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.468361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2459  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  23.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7494  extracellular solute-binding protein  23.69 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0124491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2687  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  23.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1428  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  22.22 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.275664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2603  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  23.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2417  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.71 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.131702  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1343  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.908604  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2050  extracellular solute-binding protein family 3  29.22 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3449  histidine ABC transporter, periplasmic histidine-binding protein  23.5 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4297  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.46 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.173151 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2719  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  22.71 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.15 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7504  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1635  extracellular solute-binding protein family 3  24.67 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5997  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.502118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2466  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  23.08 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  22.87 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0903  extracellular solute-binding protein family 3  25.81 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5206  ABC transporter substrate binding protein  24.49 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.587678  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.94 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2568  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.46 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6067  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6551  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.683047 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5703  extracellular solute-binding protein  29.27 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2118  extracellular solute-binding protein  23.73 
 
 		 264 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02235  lysine/arginine/ornithine transporter subunit  22.14 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1346  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.14 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00101458  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2800  extracellular solute-binding protein  23.43 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2604  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  22.14 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1342  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.14 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.232393  normal  0.759434 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2460  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  22.14 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4485  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.218316  normal  0.0251052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02195  hypothetical protein  22.14 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2859  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.22 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.582103  normal  0.224606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  28.15 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0724  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.531273  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6320  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0695145  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0717  extracellular solute-binding protein family 3  23.35 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.303541  normal  0.0145592 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  29.6 
 
 		 246 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.2 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.2 
 
 		 264 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>