More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5509 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5509  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 
277 aa  556  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0011689 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2580  extracellular solute-binding protein  54.71 
 
 
279 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.862888  normal  0.479184 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2850  extracellular solute-binding protein  47.06 
 
 
275 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.610403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3265  extracellular solute-binding protein  48.53 
 
 
275 aa  255  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2802  extracellular solute-binding protein  45.04 
 
 
273 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.602775  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0974  extracellular solute-binding protein  43.89 
 
 
273 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0265185  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  43.13 
 
 
273 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5122  extracellular solute-binding protein  42 
 
 
273 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123771  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0657  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  41.02 
 
 
275 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0691  extracellular solute-binding protein  40.62 
 
 
273 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0235172 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2998  extracellular solute-binding protein family 3  37.5 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  31.92 
 
 
257 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2588  extracellular solute-binding protein  33.21 
 
 
270 aa  122  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3742  extracellular solute-binding protein  32.39 
 
 
261 aa  122  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2848  extracellular solute-binding protein  31.45 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0787958  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  32.62 
 
 
266 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.15 
 
 
264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 
264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.77 
 
 
266 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.52 
 
 
266 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.2 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.2 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.2 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.2 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.2 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.2 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2603  extracellular solute-binding protein  30.32 
 
 
262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.426319  hitchhiker  0.00328337 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  31.68 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1377  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000115158  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.2 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1475  extracellular solute-binding protein  30.8 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0743  extracellular solute-binding protein  33.79 
 
 
260 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1758  hook assembly protein, flagella  32.5 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000345404  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4695  ABC polar amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.4 
 
 
264 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.344661  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  30.04 
 
 
258 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3056  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.78 
 
 
320 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.114315  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.78 
 
 
315 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3091  ABC transporter, substrate binding component  31.78 
 
 
266 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  30.4 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2764  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 
266 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
266 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3585  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
266 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.435512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.48 
 
 
266 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.56 
 
 
264 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  29.35 
 
 
270 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
266 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 
266 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  30.15 
 
 
275 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1942  extracellular solute-binding protein family 3  27.87 
 
 
266 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000237139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0983  extracellular solute-binding protein family 3  32.14 
 
 
264 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0154796  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  29.2 
 
 
264 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1295  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.7 
 
 
267 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.397869 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2031  cystine transporter subunit  27.8 
 
 
266 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2274  cystine transporter subunit  27.8 
 
 
266 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  31.48 
 
 
275 aa  102  6e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2376  cystine transporter subunit  27.8 
 
 
266 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3277  extracellular solute-binding protein family 3  31.43 
 
 
264 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0344  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 
264 aa  102  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2134  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.4 
 
 
264 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2003  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.4 
 
 
313 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.385413  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2110  cystine transporter subunit  27.08 
 
 
266 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.587115  normal  0.0126347 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2611  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.4 
 
 
313 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.85 
 
 
250 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1166  cystine transporter subunit  27.08 
 
 
266 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.379234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0777  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  31.4 
 
 
313 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  27.08 
 
 
266 aa  100  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2116  cystine transporter subunit  26.71 
 
 
266 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000583389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2169  cystine transporter subunit  26.71 
 
 
266 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000488454 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1289  cystine transporter subunit  26.71 
 
 
266 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000238805 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 
261 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
253 aa  99.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3950  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 
258 aa  99.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0631  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.58 
 
 
253 aa  99.4  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.00542513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0593  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  31.58 
 
 
253 aa  99.4  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  27.51 
 
 
265 aa  99  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0468  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  28.27 
 
 
264 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0416  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.85 
 
 
264 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2350  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter amino acid-binding protein/permease  28.72 
 
 
502 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.140877  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2062  glutamine-binding periplasmic protein of glutamine ABC transporter  28.72 
 
 
502 aa  98.2  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2019  cystine transporter subunit  25.63 
 
 
266 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.579561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1719  cystine transporter subunit  26.69 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.470206 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28.06 
 
 
265 aa  97.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0353  amino acid ABC transporter solute binding protein  27.43 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0336  amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  27.43 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.137288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0367  putative amino acid ABC transporter substrate-binding protein  27.43 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2062  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.89 
 
 
499 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2154  cystine transporter subunit  26.69 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0349557  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1926  solute-binding family 1 protein  29.45 
 
 
250 aa  97.8  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  26.69 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0402  putative amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  27.43 
 
 
264 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1262  cystine transporter subunit  26.69 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0848905  normal  0.0261829 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0339  amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  26.58 
 
 
264 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>