More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4076 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4076  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 		 500 aa  1006    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1755  succinate semialdehyde dehydrogenase  68.9 
 
 		 497 aa  690    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30180  succinate semialdehyde dehydrogenase  58.97 
 
 		 487 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.559382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1915  Aldehyde Dehydrogenase  59.15 
 
 		 485 aa  556  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4757  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  58.87 
 
 		 487 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2949  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.85 
 
 		 489 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1202  Aldehyde Dehydrogenase  56.12 
 
 		 487 aa  511  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0940218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4961  Aldehyde Dehydrogenase  55.86 
 
 		 487 aa  501  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4403  Aldehyde Dehydrogenase  54.23 
 
 		 496 aa  501  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1786  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.02 
 
 		 493 aa  499  1e-140  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27380  succinate semialdehyde dehydrogenase  53.29 
 
 		 489 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.723278  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36980  succinate semialdehyde dehydrogenase  54.64 
 
 		 484 aa  494  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.037708 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4451  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.5 
 
 		 493 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2927  Aldehyde Dehydrogenase  55.03 
 
 		 491 aa  489  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00501178  normal  0.281874 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1228  Aldehyde Dehydrogenase  53.73 
 
 		 489 aa  485  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0735  Aldehyde Dehydrogenase  52.02 
 
 		 490 aa  487  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0429832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4598  succinate semialdehyde dehydrogenase  56.99 
 
 		 485 aa  482  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.893745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4419  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  56.24 
 
 		 482 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.219338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4999  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  52.93 
 
 		 495 aa  484  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416466  normal  0.785793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4333  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  56.49 
 
 		 476 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.393848  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4713  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  56.03 
 
 		 482 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23320  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.45 
 
 		 490 aa  477  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0258087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4473  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.01 
 
 		 486 aa  478  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0104  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  52.32 
 
 		 491 aa  472  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.108131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3337  Aldehyde Dehydrogenase  53.2 
 
 		 487 aa  474  1e-132  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1277  Aldehyde Dehydrogenase  54.27 
 
 		 499 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000107333 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1309  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  55.74 
 
 		 483 aa  469  1.0000000000000001e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.858755  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0078  Aldehyde Dehydrogenase  54.6 
 
 		 502 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11280  succinate semialdehyde dehydrogenase  52.46 
 
 		 500 aa  468  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0554894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1207  succinate semialdehyde dehydrogenase  55.23 
 
 		 514 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.358001  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  50.1 
 
 		 482 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1858  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  57.45 
 
 		 485 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234368  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4876  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  57.02 
 
 		 482 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.892375  normal  0.621517 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5259  aldehyde dehydrogenase  51.05 
 
 		 487 aa  458  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05360  succinate semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0233509  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0243  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  49.9 
 
 		 492 aa  456  1e-127  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0048  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.89 
 
 		 488 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0300  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.06 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.648676 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2783  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)(+))  49.06 
 
 		 481 aa  454  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.959595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1116  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.64 
 
 		 482 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.85 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1526  Succinate-semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 489 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.515209  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.06 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.84 
 
 		 484 aa  449  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.13 
 
 		 486 aa  450  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.89 
 
 		 479 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  49.06 
 
 		 480 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.85 
 
 		 480 aa  449  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.1 
 
 		 483 aa  450  1e-125  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4850  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.55 
 
 		 486 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.08 
 
 		 493 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1425  aldehyde dehydrogenase  52.98 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257267  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1568  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.37 
 
 		 488 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6301  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.35 
 
 		 492 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3395  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.93 
 
 		 509 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.610857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0692  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.87 
 
 		 477 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4617  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.69 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224958  normal  0.233649 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1485  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.39 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.464618  hitchhiker  0.00159215 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6021  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.15 
 
 		 486 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  47.69 
 
 		 482 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.69 
 
 		 482 aa  442  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.69 
 
 		 482 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.69 
 
 		 482 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.76 
 
 		 481 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  48.02 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0274  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.79 
 
 		 492 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.48 
 
 		 482 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.43 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4277  succinate semialdehyde dehydrogenase  50.21 
 
 		 491 aa  443  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.512531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5660  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.02 
 
 		 484 aa  444  1e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2544  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.4 
 
 		 490 aa  444  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.642859  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6772  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.02 
 
 		 502 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3363  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.02 
 
 		 489 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.159343 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.43 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  47.69 
 
 		 482 aa  443  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  49.48 
 
 		 494 aa  443  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.69 
 
 		 482 aa  443  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.22 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0700  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.65 
 
 		 503 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5242  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.39 
 
 		 489 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.426538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.6 
 
 		 480 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4208  succinate semialdehyde dehydrogenase  48.78 
 
 		 500 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.485625  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0786  succinic semialdehyde dehydrogenase  49.9 
 
 		 493 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0646  succinate semialdehyde dehydrogenase  51.84 
 
 		 459 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.48 
 
 		 482 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.43 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  47.18 
 
 		 480 aa  437  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0279  succinate semialdehyde dehydrogenase  46.97 
 
 		 489 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4908  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.18 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3263  succinate semialdehyde dehydrogenase  47.78 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132134 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.18 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0656  succinic semialdehyde dehydrogenase  48.44 
 
 		 503 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.131499 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.63 
 
 		 482 aa  436  1e-121  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4712  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.39 
 
 		 489 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  48.01 
 
 		 483 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5362  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.18 
 
 		 489 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.52 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2886  succinic semialdehyde dehydrogenase  51.57 
 
 		 486 aa  436  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0289  succinic semialdehyde dehydrogenase  47.07 
 
 		 490 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.63 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>