More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3907 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3907  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 123 aa  246  9e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1120  regulatory protein, ArsR  73.6 
 
 		 125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5692  regulatory protein, ArsR  73.5 
 
 		 125 aa  172  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.073008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4696  ArsR family transcriptional regulator  76.79 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4316  ArsR family transcriptional regulator  76.79 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4402  ArsR family transcriptional regulator  76.79 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3028  ArsR family transcriptional regulator  63.48 
 
 		 125 aa  134  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2041  transcriptional regulator, ArsR family  53.98 
 
 		 115 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.965187  normal  0.400743 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2464  transcriptional regulator, ArsR family  51.02 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0703378  decreased coverage  0.00378407 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02300  transcriptional regulator, ArsR family  52.68 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0872  ArsR family transcriptional regulator  50.47 
 
 		 114 aa  90.9  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10082  transcriptional regulator  51.02 
 
 		 114 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0459233  normal  0.101509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  46.81 
 
 		 125 aa  86.3  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  45.87 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.66 
 
 		 109 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3554  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.19 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00159574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4227  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19490  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229335  normal  0.0268892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4383  ArsR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4701  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0426  ArsR family transcriptional regulator  46.74 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.850787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6231  ArsR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0098  ArsR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3775  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 		 118 aa  72.4  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409508  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  31.52 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3406  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.692409  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  31.52 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  41.56 
 
 		 105 aa  65.9  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3721  ArsR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2025  regulatory protein ArsR  38.1 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.650205  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 100 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  38.2 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0439  transcriptional regulator  37.63 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000113831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0245  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13897  normal  0.794809 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1441  regulatory protein, ArsR  38.75 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  36.17 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  32.67 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1900  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  40.45 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 111 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1486  regulatory protein ArsR  35.79 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.543116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1936  transcriptional regulator, ArsR family  36.11 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0829  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 		 87 aa  58.9  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000111816  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  30.77 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3618  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  32.94 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2281  transcriptional regulator, ArsR family  35.42 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2776  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3675  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.888479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1210  regulatory protein, ArsR  33.78 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1894  regulatory protein ArsR  29.91 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  33.71 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2970  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  32.18 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 92 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0960  ArsR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.766559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3027  transcriptional regulator, ArsR family  38.96 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.291968  normal  0.013855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  31.58 
 
 		 109 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1742  transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  29.21 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1709  regulatory protein, ArsR  36.47 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.641159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  34.62 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  35.05 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2722  transcriptional regulator, ArsR family  31.82 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000708093  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2351  ArsR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.666716  hitchhiker  0.00040257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3836  regulatory protein, ArsR  34.25 
 
 		 102 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4063  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 113 aa  53.5  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3258  rhodanese domain-containing protein  37.07 
 
 		 226 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2372  ArsR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.133078  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2126  ArsR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.436052  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  32.47 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0488  ArsR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0846  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  37.04 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  34.94 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 95 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2625  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4373  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1479  transcriptional regulator, ArsR family  34.62 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1905  transcriptional regulator, ArsR family  32.1 
 
 		 114 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0756  transcriptional regulator, ArsR family  30.09 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0073  ArsR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.77483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3225  regulatory protein ArsR  35.9 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.151023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0011  regulatory protein, ArsR  39.44 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>