More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3192 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 220 aa  432  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  67.89 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  67.89 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  67.89 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  70.75 
 
 		 234 aa  272  4.0000000000000004e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  65.74 
 
 		 223 aa  266  2e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  67.89 
 
 		 225 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  65.6 
 
 		 224 aa  241  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  52.38 
 
 		 203 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  45.93 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  46.67 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  43.46 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  42.25 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 243 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  42.58 
 
 		 228 aa  118  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  40.21 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  36.62 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.9 
 
 		 210 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  38.43 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  38.21 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  42.5 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  37.8 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 198 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  30.53 
 
 		 281 aa  105  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.22 
 
 		 202 aa  105  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  39.27 
 
 		 210 aa  101  8e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 215 aa  100  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.28 
 
 		 382 aa  99.8  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 225 aa  99.4  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 207 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.58 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 		 227 aa  98.6  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 		 209 aa  98.2  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 		 195 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  39.75 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  44.6 
 
 		 369 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  37.93 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  39.38 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 208 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 205 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 210 aa  94.7  8e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  40.24 
 
 		 205 aa  94.7  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.43 
 
 		 205 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  39.63 
 
 		 224 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 		 195 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  35.2 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 209 aa  92.8  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  47.01 
 
 		 440 aa  93.2  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  39.64 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 185 aa  92  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  41.46 
 
 		 218 aa  92  7e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  40.43 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  38.61 
 
 		 370 aa  90.1  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  33.85 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  42.07 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 209 aa  89  6e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  33.78 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 223 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  36.07 
 
 		 412 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  31.31 
 
 		 212 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  35.84 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 220 aa  85.9  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  33.16 
 
 		 229 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  33.16 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  33.16 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  40.41 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.44 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.75 
 
 		 378 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.34 
 
 		 356 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30400  predicted protein  36.09 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.923581 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>