More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1666 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  94.26 
 
 		 209 aa  410  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  61.72 
 
 		 209 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  59.62 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  60.39 
 
 		 251 aa  265  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  58.65 
 
 		 209 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  56.52 
 
 		 207 aa  254  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  49.28 
 
 		 210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  48.54 
 
 		 210 aa  207  7e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  49.76 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  45.59 
 
 		 213 aa  198  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  47.12 
 
 		 205 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  46.41 
 
 		 213 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  47.12 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  45.19 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  43.54 
 
 		 209 aa  184  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  40.38 
 
 		 207 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  43.06 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  45.85 
 
 		 219 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  44.44 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  45.15 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  44.95 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  41.55 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  41.15 
 
 		 213 aa  174  7e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  41.83 
 
 		 205 aa  174  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  41.15 
 
 		 218 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1782  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00356762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  43.33 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2054  beta-lactamase domain protein  42.86 
 
 		 215 aa  171  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  42.11 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2240  beta-lactamase domain-containing protein  44.39 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  40.67 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  41.15 
 
 		 218 aa  168  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  41.83 
 
 		 207 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  40.31 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  40.38 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  41.83 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  41.62 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1732  beta-lactamase domain-containing protein  41.63 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37479  normal  0.0747191 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  42.31 
 
 		 214 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  41.35 
 
 		 206 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  40 
 
 		 214 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  41.84 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  43.41 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  39.52 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0334  beta-lactamase domain-containing protein  39.42 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  41.15 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  39.29 
 
 		 214 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  41.33 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  41.83 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  38.65 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  37.5 
 
 		 212 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  39.05 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  38.83 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  38.57 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  41.12 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  38.57 
 
 		 237 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  40.19 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  38.57 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0167  beta-lactamase-like  39.52 
 
 		 212 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1662  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0113  beta-lactamase-like  43.37 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.110968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  41.04 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  38.73 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  40.82 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1634  beta-lactamase domain protein  37.62 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0717617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  38.94 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.32 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41150  metallo beta-lactamase-like protein  41.83 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3466  beta-lactamase domain protein  41.21 
 
 		 218 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  38.92 
 
 		 222 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1648  beta-lactamase domain-containing protein  41.41 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0233  beta-lactamase-like  41.12 
 
 		 230 aa  154  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0772  beta-lactamase domain protein  39.9 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  42.45 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  38.1 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1517  metallo-beta-lactamase family protein  41.41 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3119  beta-lactamase domain-containing protein  40.1 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603346  normal  0.30493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3159  hydrolase  41.84 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  37.62 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  38.1 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2734  beta-lactamase domain-containing protein  36.54 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1467  metallo-beta-lactamase family protein  41.41 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  38.1 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  36.59 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>