More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2238 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2238  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
421 aa  842    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1998  major facilitator superfamily MFS_1  67.07 
 
 
423 aa  535  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000565006  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2847  major facilitator family transporter  25.64 
 
 
424 aa  164  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000267919 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0936  major facilitator family transporter  26.88 
 
 
418 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.98458e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0800  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
418 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0840  major facilitator family transporter  26.63 
 
 
418 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5676  major facilitator transporter  26.79 
 
 
424 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.858387  decreased coverage  0.000722949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0749  multidrug resistance protein B  26.63 
 
 
418 aa  160  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.384437  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0231  major facilitator transporter  27.32 
 
 
424 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0744  multidrug resistance protein B  25.9 
 
 
418 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1025  major facilitator family transporter  26.13 
 
 
418 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0896  major facilitator family transporter  26.13 
 
 
418 aa  157  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0933  major facilitator family transporter  25.88 
 
 
418 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5066  major facilitator family transporter  26.02 
 
 
423 aa  153  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00487655  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0259  major facilitator family transporter  26.02 
 
 
423 aa  153  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129777  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0264  major facilitator family transporter  25.77 
 
 
423 aa  152  8e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0402115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0278  major facilitator family transporter  25.77 
 
 
423 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  25.19 
 
 
423 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0216  permease; multidrug resistance protein  25.19 
 
 
423 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  25.19 
 
 
423 aa  152  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0222  major facilitator transporter  25.77 
 
 
424 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  25.19 
 
 
423 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1844  major facilitator superfamily permease  26.75 
 
 
409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0218  permease; multidrug resistance protein  25 
 
 
423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2097  transporter, putative  26.35 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2952  permease  23.75 
 
 
417 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000966288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4410  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 
419 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0163  major facilitator transporter  25.46 
 
 
416 aa  117  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  26.6 
 
 
407 aa  110  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  25.97 
 
 
398 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2690  major facilitator transporter  25.06 
 
 
401 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2606  major facilitator transporter  25.97 
 
 
412 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2466  major facilitator superfamily permease  23.74 
 
 
406 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3324  multidrug resistance protein B; transporter permease  25.5 
 
 
412 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2885  major facilitator family transporter  23.8 
 
 
412 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734692 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1587  hypothetical protein  24.87 
 
 
413 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0149232 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3730  hypothetical protein  24.74 
 
 
412 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2223  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
445 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00013617  hitchhiker  0.000156735 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2112  major facilitator superfamily permease  28.01 
 
 
405 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.954954  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2637  MFS superfamily peptide permease  23.8 
 
 
412 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4388  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
419 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2688  major facilitator family transporter  23.56 
 
 
412 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.278586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2882  major facilitator family transporter  23.56 
 
 
412 aa  97.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2899  peptide permease  24.93 
 
 
404 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0168  major facilitator transporter  21.88 
 
 
416 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3641  hypothetical protein  25.6 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2613  MFS superfamily peptide permease  24.01 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.713108  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0163  major facilitator transporter  21.88 
 
 
416 aa  97.1  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2933  major facilitator family transporter  24.01 
 
 
412 aa  97.1  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000168922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2859  major facilitator transporter  24.5 
 
 
381 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  23.56 
 
 
423 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2346  peptide permease  24.6 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0385238  hitchhiker  0.0021515 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2464  major facilitator transporter  26.89 
 
 
417 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.532974  normal  0.0764442 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3308  major facilitator transporter  23.99 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.943572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2921  major facilitator family transporter  22.46 
 
 
412 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000255347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1170  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 
417 aa  90.5  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000206614  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4255  major facilitator transporter  25.75 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2847  putative MFS transporter family protein  24.71 
 
 
427 aa  88.2  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.778144  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  24.1 
 
 
395 aa  86.7  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2339  drug transporter, putative  20.44 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0267  hypothetical protein  24.7 
 
 
434 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2076  major facilitator transporter  24.77 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.754596  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4917  major facilitator transporter  25.77 
 
 
419 aa  81.6  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0995629 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4401  major facilitator transporter  29.78 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.868968  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1696  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 
392 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1258  putative MFS transporter family protein  23.61 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2468  major facilitator transporter  22.34 
 
 
460 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0361847  normal  0.102149 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2765  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000543377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4024  major facilitator transporter  26.17 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.959779  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0744  major facilitator transporter  28.26 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.871557 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06064  hypothetical protein  24.8 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1293  major facilitator transporter  26.4 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756412  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0854  major facilitator transporter  22.82 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  25.59 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2352  major facilitator transporter  22.13 
 
 
460 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.138408  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  25.59 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  25.59 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2079  multidrug resistance protein MdtH  22.73 
 
 
401 aa  77  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0994516  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2363  major facilitator transporter  22.53 
 
 
464 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2050  multidrug resistance protein MdtH  23.41 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1995  major facilitator superfamily MFS_1  21.54 
 
 
464 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230146  hitchhiker  0.000000379141 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2443  multidrug resistance protein MdtH  23.41 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.313716  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2162  multidrug resistance protein MdtH  23.41 
 
 
401 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.976846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1802  multidrug resistance protein MdtH  22.44 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4401  major facilitator transporter  28.19 
 
 
416 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.678364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1069  major facilitator transporter  24.68 
 
 
421 aa  73.2  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0810  major facilitator transporter  24.11 
 
 
416 aa  73.2  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000673475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0401  major facilitator transporter  25.19 
 
 
450 aa  72  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0878696  normal  0.0116181 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2276  multidrug resistance protein MdtH  25.63 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2796  multidrug resistance protein MdtH  22.85 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.141154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01061  predicted drug efflux system  21.53 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2581  major facilitator superfamily MFS_1  21.53 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.487081  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2064  multidrug resistance protein MdtH  21.53 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.182289 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2261  multidrug resistance protein MdtH  21.53 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4876  putative permease  24.79 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4473  permease; multidrug resistance protein  24.79 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1188  multidrug resistance protein MdtH  21.53 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01069  hypothetical protein  21.53 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0124  major facilitator transporter  24.44 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.137137  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4862  putative permease  24.79 
 
 
397 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>