31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1190 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  100 
 
 
248 aa  512  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  64.78 
 
 
249 aa  318  6e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  38.87 
 
 
264 aa  159  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  34.41 
 
 
256 aa  157  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  33.2 
 
 
248 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  33.6 
 
 
252 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  35.39 
 
 
243 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  34.76 
 
 
240 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  32.93 
 
 
244 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  34.94 
 
 
246 aa  149  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  36.69 
 
 
249 aa  148  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  34.65 
 
 
247 aa  142  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  33.07 
 
 
251 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  31.98 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  37.05 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  30.8 
 
 
250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  32 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  30.28 
 
 
250 aa  109  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  31.58 
 
 
242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  31.75 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  30.04 
 
 
261 aa  107  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  26.94 
 
 
265 aa  95.9  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  28.84 
 
 
264 aa  88.6  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  24.63 
 
 
267 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  29.65 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  21.05 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0666  CRISPR-associated protein Cas6  56.76 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  23.57 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  25.63 
 
 
246 aa  46.6  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  26.18 
 
 
291 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0121  CRISPR-associated protein Cas6  30.99 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.127158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>