273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2548 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2548  rod shape-determining protein MreC  100 
 
 
288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0372801  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0901  rod shape-determining protein MreC  78.82 
 
 
288 aa  474  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4297  rod shape-determining protein MreC  57.4 
 
 
283 aa  344  8e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0664  rod shape-determining protein MreC  57.97 
 
 
283 aa  343  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3166  rod shape-determining protein MreC  58.33 
 
 
285 aa  342  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4570  rod shape-determining protein MreC  57.45 
 
 
283 aa  337  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00639846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4349  rod shape-determining protein MreC  57.61 
 
 
283 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.287267  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4196  rod shape-determining protein MreC  57.82 
 
 
283 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4683  rod shape-determining protein MreC  57.61 
 
 
283 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4185  rod shape-determining protein MreC  57.82 
 
 
283 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4585  rod shape-determining protein MreC  57.25 
 
 
283 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0107516  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4531  rod shape-determining protein MreC  56.36 
 
 
283 aa  332  5e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4543  rod shape-determining protein MreC  56.88 
 
 
283 aa  332  6e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1213  rod shape-determining protein MreC  37.32 
 
 
279 aa  194  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1706  rod shape-determining protein MreC  38.41 
 
 
280 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00180064  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1739  rod shape-determining protein MreC  38.41 
 
 
280 aa  192  7e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000999106  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0513  rod shape-determining protein MreC  33.68 
 
 
285 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4663  rod shape-determining protein MreC  40.81 
 
 
255 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1389  rod shape-determining protein MreC  36.5 
 
 
283 aa  179  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0286  rod shape-determining protein MreC  39.91 
 
 
253 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0574  rod shape-determining protein MreC  30.5 
 
 
285 aa  166  5e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.931469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0516  rod shape-determining protein MreC  34.78 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000408962 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1823  rod shape-determining protein MreC  30.28 
 
 
288 aa  152  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2547  rod shape-determining protein MreC  33.21 
 
 
286 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1214  rod shape-determining protein MreC  30.91 
 
 
283 aa  150  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0182396  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0538  rod shape-determining protein MreC  31.62 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.642159 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2536  rod shape-determining protein MreC  33.47 
 
 
291 aa  146  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1640  rod shape-determining protein MreC  29.58 
 
 
288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000445773  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1465  rod shape-determining protein MreC  32.96 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14230  rod shape-determining protein MreC  31.23 
 
 
275 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000516691  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1069  rod shape-determining protein MreC  31.53 
 
 
271 aa  125  1e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3338  rod shape-determining protein MreC  31.23 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000318655  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2133  rod shape-determining protein MreC  28.62 
 
 
277 aa  113  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00195363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2397  rod shape-determining protein MreC  29.14 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2109  rod shape-determining protein MreC  28.78 
 
 
283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0089  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4350  rod shape-determining protein MreC  30.24 
 
 
288 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.244731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1539  rod shape-determining protein MreC  30.89 
 
 
273 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0171987  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2860  rod shape-determining protein MreC  29.35 
 
 
274 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0129837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0926  rod shape-determining protein MreC  31.64 
 
 
273 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2562  rod shape-determining protein MreC  28.41 
 
 
286 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.028075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0593  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 
277 aa  103  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000123073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1302  rod shape-determining protein MreC  33.01 
 
 
283 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.800161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2494  rod shape-determining protein MreC  28.52 
 
 
274 aa  100  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1628  rod shape-determining protein MreC  29.41 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2081  rod shape-determining protein MreC  27.49 
 
 
274 aa  98.2  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2547  rod shape-determining protein MreC  28 
 
 
272 aa  98.6  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1755  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
274 aa  95.1  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1462  rod shape-determining protein MreC  27.65 
 
 
359 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461363  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2727  rod shape-determining protein MreC  34.03 
 
 
243 aa  94.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00760389  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0040  rod shape-determining protein MreC  30.77 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0671  rod shape-determining protein MreC  27.11 
 
 
357 aa  90.9  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.960312 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0329  rod shape-determining protein MreC  27.51 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.134678  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2591  rod shape-determining protein MreC  30.18 
 
 
281 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1258  rod shape-determining protein MreC  30.48 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0759528  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2221  rod shape-determining protein MreC  31.5 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06080  rod shape-determining protein MreC  28.49 
 
 
315 aa  83.6  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000549301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4559  rod shape-determining protein MreC  27.84 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0995  rod shape-determining protein MreC  25.46 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.30539  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1686  rod shape-determining protein MreC  34.16 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.134471 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1249  rod shape-determining protein MreC  26.62 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0216084  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1350  rod shape-determining protein MreC  31.39 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1457  rod shape-determining protein MreC  30.14 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2462  rod shape-determining protein MreC  29.62 
 
 
274 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.416735  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3390  rod shape-determining protein MreC  29.11 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.135599 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2185  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 
304 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1126  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.16039  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1048  rod shape-determining protein MreC  28.46 
 
 
272 aa  79  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00267532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0115  rod shape-determining protein MreC  30.22 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4600  rod shape-determining protein MreC  26.82 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3191  rod shape-determining protein MreC  31.5 
 
 
254 aa  77  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0011283  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1406  rod shape-determining protein MreC  26.94 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.27011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3357  rod shape-determining protein MreC  28.44 
 
 
338 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.368226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0471  rod shape-determining protein MreC  29.52 
 
 
285 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14230  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1006  rod shape-determining protein MreC  26.92 
 
 
281 aa  74.7  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002384  rod shape-determining protein MreC  25.78 
 
 
299 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0567209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0573  rod shape-determining protein MreC  31.82 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.431817 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0101  rod shape-determining protein MreC  27.21 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1714  rod shape-determining protein MreC  29.25 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03684  rod shape-determining protein MreC  27.17 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4169  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00060382  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18311  rod shape-determining protein MreC  31.79 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4129  rod shape-determining protein MreC  30.81 
 
 
249 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3453  rod shape-determining protein MreC  26.61 
 
 
407 aa  73.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.968542  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1317  rod shape-determining protein MreC  24.57 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0592341  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0740  rod shape-determining protein MreC  27.24 
 
 
281 aa  72.8  0.000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.394484  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0819  rod shape-determining protein MreC  25.74 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.727253  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2239  rod shape-determining protein MreC  26.69 
 
 
317 aa  72  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2835  rod shape-determining protein MreC  26.22 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000140817  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00570  rod shape-determining protein  28.34 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.119359  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1733  Rod shape-determining protein MreC  32.28 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000284211  normal  0.185499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2492  rod shape-determining protein MreC  27.95 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.248024  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0052  rod shape-determining protein MreC  23.42 
 
 
336 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0155006  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0533  rod shape-determining protein MreC  24.52 
 
 
286 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00550121  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2659  rod shape-determining protein MreC  26.32 
 
 
295 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1368  rod shape-determining protein MreC  26.27 
 
 
291 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0839  rod shape-determining protein MreC  29.38 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.237231  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0479  rod shape-determining protein MreC  23.76 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  normal  0.489996 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1570  rod shape-determining protein MreC  29.95 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>