108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2030 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2030  peptidase M42 family protein  100 
 
 
439 aa  915    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  31.74 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  35.66 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  35.77 
 
 
370 aa  82  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  32.34 
 
 
368 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  36.31 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  33.33 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  42.71 
 
 
372 aa  77  0.0000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  35.29 
 
 
372 aa  76.6  0.0000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  28.85 
 
 
375 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  39.45 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  41.12 
 
 
365 aa  74.3  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  31.4 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0663  peptidase M42 family protein  27.39 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00234381  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  37.17 
 
 
377 aa  72  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  41.32 
 
 
368 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  40.18 
 
 
374 aa  69.7  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  42.2 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  33.11 
 
 
368 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  37 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2518  hypothetical protein  33 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  29.61 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  30.36 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  30.36 
 
 
377 aa  67.8  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  41.38 
 
 
368 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  32.64 
 
 
374 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  27.91 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  31.25 
 
 
372 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  32.32 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  26.99 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  35.71 
 
 
368 aa  60.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  33.33 
 
 
379 aa  59.3  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  37.04 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  37.04 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  37.04 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  37.04 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  37.04 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  37.04 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  37.04 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  37.5 
 
 
378 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.59 
 
 
389 aa  58.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  26.16 
 
 
403 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  35.8 
 
 
372 aa  57  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  35.8 
 
 
372 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  35.8 
 
 
372 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  33.33 
 
 
372 aa  53.9  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  42.62 
 
 
344 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  33.63 
 
 
374 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0810  aminoacyl-histidine dipeptidase  29.08 
 
 
420 aa  50.4  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000463218  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3389  aminoacyl-histidine dipeptidase  25.97 
 
 
484 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00176848  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  27.64 
 
 
346 aa  50.1  0.00008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1720  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  30 
 
 
484 aa  49.7  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  32.05 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  37.68 
 
 
357 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1343  Xaa-His dipeptidase  36.08 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  31.25 
 
 
370 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  37.11 
 
 
454 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.34 
 
 
429 aa  47.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0599  peptidase M42 family protein  29.61 
 
 
342 aa  47.8  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000044001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2506  peptidase T  33.33 
 
 
413 aa  47.8  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  29.2 
 
 
360 aa  47.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0537  aminoacyl-histidine dipeptidase  31.91 
 
 
486 aa  47  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  30.41 
 
 
410 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  28.08 
 
 
357 aa  47  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  28.49 
 
 
345 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2957  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  34.19 
 
 
487 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.974491  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1073  aminoacyl-histidine dipeptidase  30.39 
 
 
424 aa  46.2  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11078  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1121  peptidase M42 family protein  32.31 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  31.65 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  36.07 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  39.13 
 
 
417 aa  45.8  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  34.23 
 
 
461 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  34.43 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  34.43 
 
 
350 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  34.43 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  29.93 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  30.61 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  36.71 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3087  acetylornithine deacetylase  32.35 
 
 
354 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  42 
 
 
408 aa  44.7  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1387  aminoacyl-histidine dipeptidase  29.3 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0727929  unclonable  0.0000123065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  28.97 
 
 
436 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  35.05 
 
 
432 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  34.38 
 
 
452 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  25.56 
 
 
349 aa  44.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1976  peptidase T  31.88 
 
 
409 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.371679  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0680  peptidase T  31.88 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0749  peptidase T  31.88 
 
 
410 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372662  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  23.4 
 
 
401 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  31.18 
 
 
334 aa  44.3  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0681  Cellulase  28.46 
 
 
332 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2931  peptidase T  30.43 
 
 
409 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  37.7 
 
 
334 aa  43.9  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  30.43 
 
 
411 aa  43.9  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0718  peptidase M42 family protein  32.31 
 
 
363 aa  43.5  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0767  peptidase T  29.79 
 
 
408 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0758146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0784  peptidase T  29.79 
 
 
408 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0685996  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  37.31 
 
 
351 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09630  peptidase T  31.3 
 
 
408 aa  43.5  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.01 
 
 
378 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>