230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0097 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  100 
 
 
334 aa  679    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  63.17 
 
 
336 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  59.4 
 
 
339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1702  cellulase  59.1 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1120  cellulase  52.98 
 
 
340 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0681  Cellulase  56.07 
 
 
332 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  44.18 
 
 
349 aa  278  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  42.99 
 
 
348 aa  269  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2767  peptidase M42 family protein  42.6 
 
 
339 aa  262  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  44.71 
 
 
340 aa  261  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0680  peptidase M42 family protein  40.12 
 
 
336 aa  249  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1121  peptidase M42 family protein  43.43 
 
 
334 aa  247  2e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  41.77 
 
 
327 aa  245  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  39.76 
 
 
328 aa  232  8.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1758  peptidase M42 family protein  38.72 
 
 
331 aa  231  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  38.21 
 
 
346 aa  228  8e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  38.55 
 
 
334 aa  228  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  36.18 
 
 
362 aa  224  2e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  36.28 
 
 
351 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  41.93 
 
 
325 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  37.76 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1701  peptidase M42 family protein  39.02 
 
 
331 aa  220  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1702  peptidase M42 family protein  36.86 
 
 
341 aa  217  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1676  peptidase M42 family protein  40.59 
 
 
346 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  35.67 
 
 
362 aa  215  9e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  37.31 
 
 
352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  35.96 
 
 
384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  37.35 
 
 
349 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  35.78 
 
 
350 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  35.12 
 
 
342 aa  212  9e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0206  cellulase  35.71 
 
 
350 aa  211  2e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  38.53 
 
 
345 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  36.87 
 
 
350 aa  207  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  36.47 
 
 
350 aa  206  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  35.82 
 
 
350 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  35.52 
 
 
350 aa  205  9e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  38.3 
 
 
353 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  38.21 
 
 
362 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  35.52 
 
 
350 aa  204  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  37.91 
 
 
361 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.73 
 
 
356 aa  202  7e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  34.13 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  34.13 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  34.13 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.13 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.13 
 
 
356 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  36.01 
 
 
344 aa  199  7e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  34.41 
 
 
362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.13 
 
 
356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.83 
 
 
356 aa  196  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  34.02 
 
 
358 aa  196  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  34.08 
 
 
336 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  34.33 
 
 
359 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  34.34 
 
 
382 aa  193  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  35.78 
 
 
349 aa  193  3e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  34.71 
 
 
348 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1433  Cellulase  35.91 
 
 
340 aa  192  9e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  35.44 
 
 
339 aa  192  9e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  34.34 
 
 
350 aa  191  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  36.04 
 
 
361 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  36.04 
 
 
361 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  36.04 
 
 
361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  36.64 
 
 
361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  36.04 
 
 
361 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  36.04 
 
 
361 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  36.04 
 
 
361 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  36.04 
 
 
361 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  36.04 
 
 
361 aa  189  4e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  35.44 
 
 
361 aa  189  5e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  35.74 
 
 
361 aa  188  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  35.59 
 
 
345 aa  187  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  33.92 
 
 
357 aa  185  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  34.91 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  34.91 
 
 
358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  36.04 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  33.24 
 
 
345 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1762  peptidase M42 family protein  35.82 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.903048  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1305  glutamyl-aminopeptidase  34.93 
 
 
361 aa  182  5.0000000000000004e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000937587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  32.93 
 
 
358 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0895  Cellulase  33.33 
 
 
355 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  34.12 
 
 
358 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  34.51 
 
 
353 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  34.12 
 
 
383 aa  179  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  30.86 
 
 
350 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  32.45 
 
 
360 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  34.41 
 
 
359 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  34.12 
 
 
356 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3359  glutamyl aminopeptidase  35.5 
 
 
357 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  34.41 
 
 
365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  34.12 
 
 
357 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  35.31 
 
 
354 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1800  glutamyl aminopeptidase  33.43 
 
 
358 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1835  glutamyl aminopeptidase  33.43 
 
 
358 aa  172  5.999999999999999e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290999  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1726  sgc region protein SgcX  34 
 
 
372 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1730  hypothetical protein  34 
 
 
372 aa  172  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.771203 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4591  M42 family peptidase  33.73 
 
 
357 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4428  M42 family deblocking aminopeptidase  33.73 
 
 
357 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4947  M42 family peptidase  33.73 
 
 
357 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1729  putative sgc region protein SgcX  34 
 
 
372 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  32.75 
 
 
357 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>