225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0608 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  100 
 
 
349 aa  713    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  64.14 
 
 
348 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  49.56 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1676  peptidase M42 family protein  45.72 
 
 
346 aa  309  5.9999999999999995e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2767  peptidase M42 family protein  45.29 
 
 
339 aa  300  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  44.18 
 
 
334 aa  278  1e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  45.83 
 
 
336 aa  273  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  42.99 
 
 
339 aa  268  1e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0681  Cellulase  44.65 
 
 
332 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1702  cellulase  42.09 
 
 
339 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1120  cellulase  41.19 
 
 
340 aa  259  7e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  42.04 
 
 
327 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  38.6 
 
 
361 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  40.96 
 
 
353 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  39.71 
 
 
362 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  38.51 
 
 
346 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  40.47 
 
 
350 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  37.61 
 
 
350 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  40.18 
 
 
350 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  38.42 
 
 
357 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  38.66 
 
 
350 aa  246  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  40.18 
 
 
350 aa  247  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  39.53 
 
 
351 aa  247  3e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  39.7 
 
 
350 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  38.55 
 
 
358 aa  241  2e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  37.87 
 
 
349 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  37.33 
 
 
384 aa  238  1e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  40.71 
 
 
345 aa  237  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  35.38 
 
 
361 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  34.88 
 
 
361 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  35.09 
 
 
361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  35.09 
 
 
361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  35.09 
 
 
361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  35.09 
 
 
361 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  35.09 
 
 
361 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  35.09 
 
 
361 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  35.09 
 
 
361 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  39.26 
 
 
358 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  39.26 
 
 
358 aa  235  7e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  38.84 
 
 
365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  34.8 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  35.09 
 
 
361 aa  233  5e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  38.26 
 
 
359 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  39 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  39.23 
 
 
345 aa  231  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3359  glutamyl aminopeptidase  39.2 
 
 
357 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  37.88 
 
 
362 aa  230  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  35.38 
 
 
342 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  36.69 
 
 
348 aa  229  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  38.18 
 
 
356 aa  228  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1121  peptidase M42 family protein  38.97 
 
 
334 aa  226  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4808  peptidase, M42 family  38.64 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0428  peptidase, M42 family  38.64 
 
 
357 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4813  peptidase, M42 family  38.64 
 
 
357 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4838  M42 family peptidase  38.64 
 
 
357 aa  225  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4829  peptidase, M42 family  38.64 
 
 
357 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0253333  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4527  glutamyl aminopeptidase  38.64 
 
 
357 aa  225  9e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4591  M42 family peptidase  38.35 
 
 
357 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4428  M42 family deblocking aminopeptidase  38.35 
 
 
357 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4446  M42 family deblocking aminopeptidase  38.35 
 
 
357 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0268261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4947  M42 family peptidase  38.35 
 
 
357 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  38.63 
 
 
336 aa  224  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  35.96 
 
 
352 aa  224  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0680  peptidase M42 family protein  37.05 
 
 
336 aa  223  4e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  37.39 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2745  Glutamyl aminopeptidase  36.44 
 
 
358 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000840882  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  36.49 
 
 
362 aa  219  6e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  34.5 
 
 
382 aa  218  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  34.19 
 
 
357 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  40.85 
 
 
325 aa  215  9e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  36.61 
 
 
344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1758  peptidase M42 family protein  37.31 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  36.92 
 
 
360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  36.83 
 
 
334 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  35.8 
 
 
349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1045  Glutamyl aminopeptidase  36.02 
 
 
360 aa  212  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  35.41 
 
 
356 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.52 
 
 
356 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  36.23 
 
 
328 aa  209  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1702  peptidase M42 family protein  36.12 
 
 
341 aa  208  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  38.3 
 
 
333 aa  207  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.63 
 
 
356 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1701  peptidase M42 family protein  37.31 
 
 
331 aa  206  3e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  38.35 
 
 
339 aa  206  4e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1103  Glutamyl aminopeptidase  33.91 
 
 
359 aa  206  4e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.24305 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3414  peptidase M42 family protein  36.26 
 
 
366 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.63 
 
 
356 aa  206  6e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  33.63 
 
 
356 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  33.63 
 
 
356 aa  206  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  33.63 
 
 
356 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.63 
 
 
356 aa  206  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1305  glutamyl-aminopeptidase  37.91 
 
 
361 aa  205  8e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000000937587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  35.04 
 
 
356 aa  202  8e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  39.46 
 
 
346 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  33.33 
 
 
359 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  34.1 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1943  peptidase M42 family protein  34.38 
 
 
356 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0044983  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  36.28 
 
 
345 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.33 
 
 
356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  33.43 
 
 
358 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>