229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3125 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  100 
 
 
356 aa  719    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  78.87 
 
 
356 aa  584  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  78.87 
 
 
356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  75.99 
 
 
356 aa  552  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  73.31 
 
 
357 aa  549  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1943  peptidase M42 family protein  74.44 
 
 
356 aa  548  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0044983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  76.74 
 
 
354 aa  542  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  58.82 
 
 
356 aa  427  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0048  peptidase M42 family protein  47.21 
 
 
355 aa  323  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0058  peptidase M42 family protein  46.09 
 
 
355 aa  322  6e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  45.79 
 
 
352 aa  306  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  44.85 
 
 
383 aa  297  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  44.66 
 
 
352 aa  296  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  42.42 
 
 
354 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2744  peptidase M42 family protein  44.67 
 
 
356 aa  286  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.721956  normal  0.0249561 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  42 
 
 
354 aa  285  8e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  41.41 
 
 
353 aa  275  7e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  43.59 
 
 
351 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  41.69 
 
 
359 aa  262  4.999999999999999e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  41.46 
 
 
357 aa  261  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2736  peptidase M42 family protein  37.92 
 
 
362 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271345  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2234  peptidase M42 family protein  42.98 
 
 
354 aa  249  5e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.323516 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  37.46 
 
 
359 aa  248  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.349139 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  38.29 
 
 
356 aa  246  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  39.48 
 
 
353 aa  244  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4817  peptidase M42 family protein  38.03 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.211256  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2346  peptidase M42 family protein  37.43 
 
 
366 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.728573 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05530  peptidase family protein  41.41 
 
 
411 aa  239  6.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.892794  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09738  hydrolase, putative  36.06 
 
 
362 aa  235  9e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0791803  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1139  peptidase M42 family protein  35.77 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  34.47 
 
 
350 aa  230  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0378  hypothetical protein  34.08 
 
 
357 aa  228  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.978276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  36.49 
 
 
357 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0636  peptidase M42 family protein  35.04 
 
 
371 aa  227  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0315  aminopeptidase  35.39 
 
 
359 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  35.71 
 
 
353 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  37.64 
 
 
346 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  35.82 
 
 
350 aa  220  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  32.95 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  33.24 
 
 
350 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  32.67 
 
 
350 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  39.18 
 
 
354 aa  219  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  35.88 
 
 
348 aa  219  5e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  38.44 
 
 
345 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  34.82 
 
 
365 aa  217  2e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  36.83 
 
 
358 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  35.41 
 
 
349 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  39.33 
 
 
353 aa  209  8e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  36.36 
 
 
349 aa  208  9e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  36.52 
 
 
349 aa  205  8e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  35.14 
 
 
361 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  34.38 
 
 
345 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  32 
 
 
351 aa  203  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  35.39 
 
 
361 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  35.84 
 
 
345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  35.14 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  35.76 
 
 
346 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  36.66 
 
 
325 aa  195  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  35.39 
 
 
361 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1676  peptidase M42 family protein  36.24 
 
 
346 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  35.23 
 
 
361 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  33.53 
 
 
342 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  35.11 
 
 
361 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  35.11 
 
 
361 aa  192  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  35.11 
 
 
361 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  35.11 
 
 
361 aa  192  6e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  34.55 
 
 
361 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  34.55 
 
 
361 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  34.55 
 
 
361 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  33.62 
 
 
358 aa  191  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  34.68 
 
 
327 aa  192  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  34.83 
 
 
361 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  33.43 
 
 
348 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  36.28 
 
 
344 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1677  peptidase M42 family protein  36.49 
 
 
353 aa  189  5e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  35.78 
 
 
333 aa  186  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0607  peptidase M42  39.43 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.201581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2767  peptidase M42 family protein  33.81 
 
 
339 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  31.83 
 
 
336 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  36.34 
 
 
362 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  32.76 
 
 
360 aa  177  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  35.45 
 
 
352 aa  176  5e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  34.94 
 
 
362 aa  176  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  31.9 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  33.8 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  35.23 
 
 
384 aa  169  6e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  31.27 
 
 
358 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  31.27 
 
 
358 aa  169  8e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  33.53 
 
 
334 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  31.75 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1103  Glutamyl aminopeptidase  35.33 
 
 
359 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.24305 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  32.39 
 
 
356 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  32.58 
 
 
382 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  34.2 
 
 
362 aa  167  4e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  32.39 
 
 
356 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  32.39 
 
 
356 aa  166  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  32.39 
 
 
356 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  32.39 
 
 
356 aa  166  5e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  33.72 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  32.39 
 
 
356 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>