222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0048 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0048  peptidase M42 family protein  100 
 
 
355 aa  730    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0058  peptidase M42 family protein  94.08 
 
 
355 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  47.21 
 
 
356 aa  323  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  48.7 
 
 
354 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  47.19 
 
 
356 aa  322  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  45.25 
 
 
357 aa  317  3e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  47.25 
 
 
356 aa  316  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1943  peptidase M42 family protein  46.37 
 
 
356 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0044983  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  45.33 
 
 
353 aa  300  2e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  44.97 
 
 
356 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  45.25 
 
 
356 aa  295  7e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  42.98 
 
 
354 aa  295  8e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  42.54 
 
 
352 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  42.62 
 
 
383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  41.13 
 
 
352 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2744  peptidase M42 family protein  42.07 
 
 
356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.721956  normal  0.0249561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  42.12 
 
 
351 aa  246  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  39.15 
 
 
354 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05530  peptidase family protein  43.1 
 
 
411 aa  241  2e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.892794  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  38.12 
 
 
356 aa  241  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2736  peptidase M42 family protein  37.05 
 
 
362 aa  233  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  38.35 
 
 
357 aa  229  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  38.57 
 
 
354 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  36.52 
 
 
353 aa  223  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2346  peptidase M42 family protein  34.17 
 
 
366 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.728573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0636  peptidase M42 family protein  34.76 
 
 
371 aa  219  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  36.81 
 
 
359 aa  218  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  35.23 
 
 
346 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2234  peptidase M42 family protein  38.92 
 
 
354 aa  217  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.323516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  36.59 
 
 
357 aa  216  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  36.57 
 
 
350 aa  216  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0315  aminopeptidase  34.77 
 
 
359 aa  216  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  34.94 
 
 
350 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09738  hydrolase, putative  35 
 
 
362 aa  213  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0791803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  35.23 
 
 
350 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  34.94 
 
 
350 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  34.66 
 
 
350 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  36.84 
 
 
349 aa  207  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  35.19 
 
 
359 aa  200  3e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.349139 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  34.42 
 
 
351 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  34.71 
 
 
348 aa  196  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0607  peptidase M42  34.78 
 
 
349 aa  196  7e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.201581  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0378  hypothetical protein  31.37 
 
 
357 aa  195  9e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.978276 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  35.26 
 
 
345 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  35.1 
 
 
349 aa  194  2e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  32.65 
 
 
342 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  36.99 
 
 
353 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  35.82 
 
 
362 aa  192  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  33.91 
 
 
345 aa  190  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1762  peptidase M42 family protein  33.82 
 
 
352 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.903048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1139  peptidase M42 family protein  32.35 
 
 
356 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  34.94 
 
 
362 aa  188  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  35.23 
 
 
362 aa  188  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  33.04 
 
 
349 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  31.65 
 
 
365 aa  186  6e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4817  peptidase M42 family protein  32.06 
 
 
356 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.211256  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  34.17 
 
 
362 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  33.73 
 
 
333 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  31.29 
 
 
328 aa  182  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  35.55 
 
 
344 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  32.3 
 
 
358 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  32.76 
 
 
346 aa  179  4.999999999999999e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  34.9 
 
 
325 aa  179  7e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  33.04 
 
 
352 aa  179  8e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  32.58 
 
 
361 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  31.64 
 
 
384 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  32.29 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  32.29 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  32.29 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  30.86 
 
 
350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  32.29 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  32.39 
 
 
361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  32.01 
 
 
361 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  32.01 
 
 
361 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  32.01 
 
 
361 aa  173  5e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  32.1 
 
 
361 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  31.44 
 
 
361 aa  172  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  34 
 
 
361 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  32.08 
 
 
350 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  31.18 
 
 
358 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  31.18 
 
 
358 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  32.09 
 
 
348 aa  170  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  31.1 
 
 
327 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  31.18 
 
 
359 aa  169  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  34.12 
 
 
345 aa  166  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  33.43 
 
 
362 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1677  peptidase M42 family protein  35.05 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  33.43 
 
 
336 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  34.93 
 
 
360 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  32.58 
 
 
358 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  30.48 
 
 
350 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  31.73 
 
 
382 aa  161  2e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1076  peptidase M42 family protein  30.14 
 
 
347 aa  159  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189287  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  30.81 
 
 
336 aa  157  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1045  Glutamyl aminopeptidase  34.54 
 
 
360 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  31.27 
 
 
353 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1790  sgc region protein SgcX  31.25 
 
 
372 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00171255  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0682  peptidase M42 family protein  29.94 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1549  putative sgc region protein SgcX  30.97 
 
 
372 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1726  sgc region protein SgcX  30.97 
 
 
372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.955403  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>