231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0763 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  100 
 
 		 356 aa  725    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  98.88 
 
 		 356 aa  721    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  78.87 
 
 		 356 aa  584  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  74.86 
 
 		 356 aa  547  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  74.93 
 
 		 354 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  70.51 
 
 		 357 aa  528  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1943  peptidase M42 family protein  69.3 
 
 		 356 aa  518  1e-146  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0044983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  54.75 
 
 		 356 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0048  peptidase M42 family protein  45.25 
 
 		 355 aa  295  7e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0058  peptidase M42 family protein  43.85 
 
 		 355 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  43.54 
 
 		 352 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  42.02 
 
 		 352 aa  282  7.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2744  peptidase M42 family protein  44.38 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.721956  normal  0.0249561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  42.3 
 
 		 354 aa  278  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  43.02 
 
 		 383 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  42.29 
 
 		 354 aa  275  1.0000000000000001e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  41.69 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  42.17 
 
 		 351 aa  268  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2234  peptidase M42 family protein  43.86 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.323516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  41.41 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  40.06 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05530  peptidase family protein  42.95 
 
 		 411 aa  239  5.999999999999999e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.892794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  38.15 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  37.82 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  36.03 
 
 		 359 aa  237  2e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.349139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2736  peptidase M42 family protein  37.08 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4817  peptidase M42 family protein  38.03 
 
 		 356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.211256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1139  peptidase M42 family protein  36.34 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  35.33 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  34.66 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  34.66 
 
 		 350 aa  229  8e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2346  peptidase M42 family protein  35.57 
 
 		 366 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.728573 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09738  hydrolase, putative  35.77 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0791803  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  34.38 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0315  aminopeptidase  35.43 
 
 		 359 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0378  hypothetical protein  33.52 
 
 		 357 aa  220  1.9999999999999999e-56  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.978276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  34.96 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0636  peptidase M42 family protein  34.76 
 
 		 371 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  32.86 
 
 		 351 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  37.68 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  34.39 
 
 		 350 aa  211  1e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  35.14 
 
 		 353 aa  210  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  35.26 
 
 		 345 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  36.07 
 
 		 354 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  33.82 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  33.43 
 
 		 365 aa  202  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  35.14 
 
 		 358 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  35.65 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  34.19 
 
 		 348 aa  199  6e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  35.23 
 
 		 349 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  34.12 
 
 		 346 aa  196  4.0000000000000005e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  33.9 
 
 		 342 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  38.41 
 
 		 353 aa  195  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  32 
 
 		 345 aa  195  9e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  34.27 
 
 		 361 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  33.9 
 
 		 361 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  33.99 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  33.99 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  33.99 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  33.43 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  33.99 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  33.43 
 
 		 361 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  33.43 
 
 		 361 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  33.71 
 
 		 361 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  33.43 
 
 		 361 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  32.75 
 
 		 349 aa  189  8e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  36.42 
 
 		 325 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  32.29 
 
 		 361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  33.82 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  32.04 
 
 		 336 aa  180  4e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1677  peptidase M42 family protein  34.59 
 
 		 353 aa  179  7e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  35.38 
 
 		 344 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  35.31 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  31.61 
 
 		 350 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  33.53 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  31.71 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  32.94 
 
 		 358 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1676  peptidase M42 family protein  31.74 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  35.04 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2767  peptidase M42 family protein  31.38 
 
 		 339 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  33.62 
 
 		 352 aa  170  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0607  peptidase M42  35.07 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.201581  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  33.43 
 
 		 362 aa  169  6e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  32 
 
 		 360 aa  169  7e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  34.02 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  34.02 
 
 		 356 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  32.4 
 
 		 358 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  32.4 
 
 		 358 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.43 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  32.6 
 
 		 384 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  32.94 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  32.64 
 
 		 328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  33.24 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  33.24 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.24 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  33.24 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.24 
 
 		 356 aa  162  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.92 
 
 		 356 aa  162  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  32.76 
 
 		 359 aa  159  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  33.91 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>