227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0607 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_0607  peptidase M42  100 
 
 
349 aa  706    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.201581  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1762  peptidase M42 family protein  51.59 
 
 
352 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.903048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  49.57 
 
 
346 aa  331  1e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  46.51 
 
 
353 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1677  peptidase M42 family protein  40.11 
 
 
353 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  40.45 
 
 
351 aa  256  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  41.26 
 
 
350 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  40.69 
 
 
350 aa  246  3e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  40.97 
 
 
350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  40.69 
 
 
350 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  37.96 
 
 
383 aa  242  7.999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  38.6 
 
 
342 aa  239  4e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  40.18 
 
 
333 aa  237  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  40.52 
 
 
357 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  39.6 
 
 
353 aa  229  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  39.53 
 
 
344 aa  229  6e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  41.25 
 
 
345 aa  228  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  37.54 
 
 
350 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  40.23 
 
 
361 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  39.94 
 
 
362 aa  223  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0682  peptidase M42 family protein  39.71 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  37.93 
 
 
384 aa  220  3e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  36.47 
 
 
346 aa  219  7e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  37.17 
 
 
350 aa  217  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  37.78 
 
 
362 aa  216  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1076  peptidase M42 family protein  37.68 
 
 
347 aa  210  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  39.52 
 
 
348 aa  209  8e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  36.24 
 
 
358 aa  206  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  36.93 
 
 
361 aa  206  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  36.93 
 
 
361 aa  206  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  37.43 
 
 
349 aa  205  9e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  36.59 
 
 
362 aa  204  1e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  36.65 
 
 
361 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  36.65 
 
 
361 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  36.65 
 
 
361 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  36.36 
 
 
361 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  36.65 
 
 
361 aa  204  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  36.99 
 
 
361 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  36.01 
 
 
356 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  36.36 
 
 
361 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  38.46 
 
 
382 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  35.88 
 
 
365 aa  204  2e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  36.65 
 
 
361 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  37.22 
 
 
361 aa  203  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  36.86 
 
 
358 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  36.86 
 
 
358 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  34.83 
 
 
350 aa  203  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  37.22 
 
 
362 aa  202  6e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0048  peptidase M42 family protein  35.07 
 
 
355 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  35.24 
 
 
349 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  36.2 
 
 
357 aa  199  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  35.26 
 
 
353 aa  199  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  37.84 
 
 
345 aa  199  9e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  37.79 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  35.8 
 
 
362 aa  197  3e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0058  peptidase M42 family protein  34.34 
 
 
355 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  36.34 
 
 
351 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  34.56 
 
 
352 aa  195  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  34.23 
 
 
348 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  37.35 
 
 
356 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  35.69 
 
 
354 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  35.69 
 
 
352 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05530  peptidase family protein  37.59 
 
 
411 aa  192  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.892794  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  34.55 
 
 
359 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  34.23 
 
 
354 aa  191  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0681  Cellulase  36.64 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  36.53 
 
 
340 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  34.03 
 
 
349 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  35.9 
 
 
354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  35.36 
 
 
356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  35.36 
 
 
356 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  33.72 
 
 
352 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0252  peptidase M42  33.05 
 
 
350 aa  183  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0096  peptidase M42 family protein  37.72 
 
 
339 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.241867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1943  peptidase M42 family protein  33.72 
 
 
356 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0044983  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1703  peptidase M42 family protein  35.84 
 
 
332 aa  182  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  37.13 
 
 
325 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1760  peptidase M42 family protein  35.55 
 
 
332 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1759  cellulase  34.82 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1702  cellulase  34.23 
 
 
339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  35.78 
 
 
356 aa  180  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  37.46 
 
 
345 aa  179  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2767  peptidase M42 family protein  34.73 
 
 
339 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3414  peptidase M42 family protein  35.69 
 
 
366 aa  176  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.774179  normal  0.0330149 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  32.27 
 
 
359 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1676  peptidase M42 family protein  36.28 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  33.23 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  37.23 
 
 
354 aa  174  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  31.4 
 
 
356 aa  173  5e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  33.7 
 
 
358 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  35.92 
 
 
360 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  35.61 
 
 
328 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2744  peptidase M42 family protein  33.13 
 
 
356 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.721956  normal  0.0249561 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1119  peptidase M42 family protein  32.75 
 
 
346 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  33.43 
 
 
357 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  34.42 
 
 
334 aa  169  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1121  peptidase M42 family protein  32.73 
 
 
334 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  35.03 
 
 
336 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0895  Cellulase  34.1 
 
 
355 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0687  Glutamyl aminopeptidase  30.81 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>