231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0779 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  98.88 
 
 
356 aa  721    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  100 
 
 
356 aa  725    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  78.87 
 
 
356 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  75.14 
 
 
356 aa  548  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  75.5 
 
 
354 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  70.79 
 
 
357 aa  529  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1943  peptidase M42 family protein  69.86 
 
 
356 aa  521  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0044983  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  55.03 
 
 
356 aa  404  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0048  peptidase M42 family protein  44.97 
 
 
355 aa  296  5e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0058  peptidase M42 family protein  43.58 
 
 
355 aa  294  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  43.82 
 
 
352 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  42.3 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2744  peptidase M42 family protein  44.09 
 
 
356 aa  280  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.721956  normal  0.0249561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  42.02 
 
 
354 aa  279  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  43.02 
 
 
383 aa  278  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  41.97 
 
 
353 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  42 
 
 
354 aa  274  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  42.17 
 
 
351 aa  269  7e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2234  peptidase M42 family protein  43.57 
 
 
354 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.323516 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  41.4 
 
 
359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  39.78 
 
 
353 aa  251  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  37.5 
 
 
356 aa  240  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  38.1 
 
 
357 aa  240  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05530  peptidase family protein  43.29 
 
 
411 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.892794  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  36.06 
 
 
359 aa  239  5e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.349139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2736  peptidase M42 family protein  37.08 
 
 
362 aa  236  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4817  peptidase M42 family protein  38.89 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.211256  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1139  peptidase M42 family protein  36.99 
 
 
356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  35.04 
 
 
350 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  34.38 
 
 
350 aa  230  4e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  34.38 
 
 
350 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2346  peptidase M42 family protein  35.85 
 
 
366 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.728573 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  34.09 
 
 
350 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09738  hydrolase, putative  35.77 
 
 
362 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0791803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0315  aminopeptidase  35.71 
 
 
359 aa  222  7e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0378  hypothetical protein  33.8 
 
 
357 aa  222  9e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.978276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  34.67 
 
 
357 aa  219  5e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0636  peptidase M42 family protein  35.67 
 
 
371 aa  219  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  34.38 
 
 
350 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  35.43 
 
 
353 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  37.68 
 
 
346 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  33.04 
 
 
351 aa  212  1e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  35.45 
 
 
345 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  36.07 
 
 
354 aa  206  4e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  34.1 
 
 
348 aa  206  7e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  33.71 
 
 
365 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  35.43 
 
 
358 aa  203  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  35.94 
 
 
349 aa  202  6e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1761  peptidase M42 family protein  34.47 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  32.29 
 
 
345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0608  peptidase M42  35.23 
 
 
349 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0364864  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  34.12 
 
 
346 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  38.11 
 
 
353 aa  195  9e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  34.1 
 
 
342 aa  195  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  33.71 
 
 
361 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  33.33 
 
 
361 aa  193  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  32.76 
 
 
361 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  33.05 
 
 
361 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  33.05 
 
 
361 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  33.05 
 
 
361 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  33.05 
 
 
361 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  32.76 
 
 
361 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  32.76 
 
 
361 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  32.76 
 
 
361 aa  189  5e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  33.05 
 
 
361 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  32.46 
 
 
349 aa  189  9e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  36.1 
 
 
325 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  32 
 
 
361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  33.53 
 
 
327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2766  peptidase M42 family protein  31.74 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1213  peptidase M42 family protein  35.67 
 
 
344 aa  180  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1677  peptidase M42 family protein  34.59 
 
 
353 aa  179  8e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  35.31 
 
 
362 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  32 
 
 
362 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1676  peptidase M42 family protein  32.02 
 
 
346 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  31.9 
 
 
350 aa  176  5e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  33.14 
 
 
345 aa  176  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  33.04 
 
 
358 aa  175  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  34.2 
 
 
352 aa  173  5e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2767  peptidase M42 family protein  31.67 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0607  peptidase M42  35.36 
 
 
349 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.201581  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0377  cellulase  34.42 
 
 
340 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  34.22 
 
 
333 aa  170  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.91 
 
 
356 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  33.43 
 
 
362 aa  170  3e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  32.03 
 
 
358 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  32.03 
 
 
358 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  31.71 
 
 
360 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.33 
 
 
356 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0867  peptidase M42 family protein  32.94 
 
 
382 aa  166  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.937418  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  33.05 
 
 
384 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1760  peptidase M42 family protein  32.34 
 
 
328 aa  166  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  33.52 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  33.52 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.52 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  33.52 
 
 
356 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.52 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  33.81 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  33.91 
 
 
362 aa  160  2e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  32.76 
 
 
359 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>