222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2346 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2346  peptidase M42 family protein  100 
 
 
366 aa  759    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.728573 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0636  peptidase M42 family protein  70.52 
 
 
371 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2736  peptidase M42 family protein  67.59 
 
 
362 aa  531  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09738  hydrolase, putative  65.65 
 
 
362 aa  502  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0791803  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4817  peptidase M42 family protein  62.85 
 
 
356 aa  489  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.211256  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0315  aminopeptidase  62.95 
 
 
359 aa  485  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1139  peptidase M42 family protein  60.61 
 
 
356 aa  471  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0378  hypothetical protein  60.89 
 
 
357 aa  456  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.978276 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  42.22 
 
 
359 aa  290  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.349139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  39.89 
 
 
357 aa  256  5e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1943  peptidase M42 family protein  38.38 
 
 
356 aa  248  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0044983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  37.43 
 
 
356 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  36.13 
 
 
357 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  36.78 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  36.13 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  35.85 
 
 
356 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  35.57 
 
 
356 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  36.84 
 
 
353 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0058  peptidase M42 family protein  33.89 
 
 
355 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0048  peptidase M42 family protein  34.17 
 
 
355 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  35.76 
 
 
356 aa  219  6e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  35.12 
 
 
359 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  32.68 
 
 
353 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  32.18 
 
 
356 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2234  peptidase M42 family protein  36.47 
 
 
354 aa  199  5e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.323516 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2744  peptidase M42 family protein  33.71 
 
 
356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.721956  normal  0.0249561 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  35.14 
 
 
351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  31.55 
 
 
352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  30.7 
 
 
354 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  33.24 
 
 
362 aa  192  5e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  32.6 
 
 
362 aa  193  5e-48  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  33.42 
 
 
362 aa  192  7e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  34.77 
 
 
383 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  34.19 
 
 
384 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  30.7 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  32.29 
 
 
362 aa  183  3e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  29.58 
 
 
354 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  32.29 
 
 
357 aa  176  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  31.91 
 
 
350 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  31.71 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  35.06 
 
 
358 aa  172  9e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  29.97 
 
 
350 aa  171  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  29.97 
 
 
350 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  33.24 
 
 
361 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  29.97 
 
 
350 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  33.24 
 
 
361 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  32.95 
 
 
361 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  32.95 
 
 
361 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  32.95 
 
 
361 aa  170  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  32.95 
 
 
361 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  33.24 
 
 
361 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  32.95 
 
 
361 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  33.24 
 
 
361 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  33.24 
 
 
361 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  30.31 
 
 
350 aa  169  7e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  32.85 
 
 
361 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  33.05 
 
 
362 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  32.85 
 
 
361 aa  168  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  29.32 
 
 
354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0522  hypothetical protein  32.38 
 
 
374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  33.03 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05530  peptidase family protein  29.54 
 
 
411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.892794  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  31.4 
 
 
365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0546  hypothetical protein  32.09 
 
 
374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  33.63 
 
 
346 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  31.79 
 
 
349 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  32.93 
 
 
345 aa  158  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  33.53 
 
 
353 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  31.92 
 
 
356 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  31.92 
 
 
356 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  30.79 
 
 
336 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  31.92 
 
 
356 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03732  hypothetical protein  31.92 
 
 
356 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  31.64 
 
 
356 aa  156  4e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4119  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  31.92 
 
 
356 aa  157  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  31.85 
 
 
334 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4428  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  31.36 
 
 
356 aa  154  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  34.38 
 
 
345 aa  153  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  31.3 
 
 
348 aa  153  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  31.79 
 
 
349 aa  153  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0208  peptidase M42 family protein  32.75 
 
 
334 aa  149  7e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.53357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  32.91 
 
 
325 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  32.19 
 
 
353 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5349  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  30.51 
 
 
356 aa  146  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  31.46 
 
 
358 aa  146  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  31.46 
 
 
358 aa  146  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  34.46 
 
 
345 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1401  M42 glutamyl aminopeptidase  31.4 
 
 
350 aa  144  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.413323  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0313  Cellulase  31.01 
 
 
342 aa  144  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1760  peptidase M42 family protein  32.42 
 
 
332 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1762  peptidase M42 family protein  30.79 
 
 
352 aa  144  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.903048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0607  peptidase M42  35.21 
 
 
349 aa  143  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.201581  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  30.34 
 
 
346 aa  143  6e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0428  peptidase, M42 family  30.77 
 
 
357 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1703  peptidase M42 family protein  32.35 
 
 
332 aa  142  7e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4808  peptidase, M42 family  30.77 
 
 
357 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  30.64 
 
 
350 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  30.17 
 
 
327 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4591  M42 family peptidase  30.49 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4428  M42 family deblocking aminopeptidase  30.49 
 
 
357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>