221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4817 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4817  peptidase M42 family protein  100 
 
 
356 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.211256  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1139  peptidase M42 family protein  82.02 
 
 
356 aa  625  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.743458 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0315  aminopeptidase  66.29 
 
 
359 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0636  peptidase M42 family protein  65.27 
 
 
371 aa  493  9.999999999999999e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2346  peptidase M42 family protein  62.85 
 
 
366 aa  489  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.917875  normal  0.728573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2736  peptidase M42 family protein  63.2 
 
 
362 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.271345  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09738  hydrolase, putative  63.94 
 
 
362 aa  486  1e-136  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0791803  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0378  hypothetical protein  58.99 
 
 
357 aa  455  1e-127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.978276 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0537  peptidase M42 family protein  43.79 
 
 
359 aa  300  2e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.349139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0820  peptidase M42 family protein  40.51 
 
 
357 aa  265  8e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.898697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2294  peptidase M42  39.44 
 
 
356 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.365569  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2196  hydrolase, putative  39.32 
 
 
354 aa  250  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.84144  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3125  peptidase M42 family protein  38.03 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.612233  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2098  peptidase M42 family protein  37.46 
 
 
353 aa  243  5e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.940358 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1385  peptidase M42 family protein  36.34 
 
 
357 aa  242  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0763  peptidase M42 family protein  38.03 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0779  peptidase M42 family protein  38.89 
 
 
356 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0675  peptidase M42 family protein  36.87 
 
 
359 aa  233  4.0000000000000004e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.873369  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1216  putative lyase/synthase  36.03 
 
 
356 aa  228  9e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0144913  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1943  peptidase M42 family protein  36.99 
 
 
356 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0044983  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1335  peptidase M42 family protein  34.3 
 
 
356 aa  219  5e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.768278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2744  peptidase M42 family protein  35.06 
 
 
356 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.721956  normal  0.0249561 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2234  peptidase M42 family protein  37.24 
 
 
354 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.323516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0738  peptidase M42  33.99 
 
 
353 aa  203  4e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.511886  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1966  peptidase M42 family protein  35.47 
 
 
383 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0452  cellulase  33.33 
 
 
362 aa  186  5e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.547156  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0048  peptidase M42 family protein  32.06 
 
 
355 aa  186  6e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0058  peptidase M42 family protein  31.76 
 
 
355 aa  186  8e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0232  peptidase M42 family protein  32.01 
 
 
352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1432  cellulase  34.49 
 
 
362 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.26952  normal  0.0787337 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0842  cellulase  31.84 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1376  peptidase M42 family protein  30.29 
 
 
354 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376322  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0999  peptidase M42 family protein  34.11 
 
 
351 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1994  peptidase M42  33.52 
 
 
354 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000914633  normal  0.691904 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0542  cellulase  33.62 
 
 
362 aa  179  9e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.192278  hitchhiker  0.00117454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0349  peptidase M42 family protein  31.73 
 
 
352 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.326281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1390  peptidase M42 family protein  30.03 
 
 
354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0386243  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05530  peptidase family protein  35.46 
 
 
411 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.892794  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0950  cellulase  31.64 
 
 
384 aa  172  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.374031  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0712  cellulase  32.65 
 
 
350 aa  170  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0912  peptidase M42  34.59 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4467  M42 family peptidase  30.29 
 
 
361 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0619409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4815  M42 family peptidase  30.29 
 
 
361 aa  162  9e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000499602  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1324  peptidase M42 family protein  32.14 
 
 
333 aa  161  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.229406  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4313  glucanase/ deblocking aminopeptidase  30 
 
 
361 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230763  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4402  cellulase  30 
 
 
361 aa  161  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.078585  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3257  cellulase  30 
 
 
361 aa  161  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0039122  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0934  peptidase M42 family protein  33.53 
 
 
349 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4702  M42 family peptidase  29.71 
 
 
361 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201284  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4302  glucanase/ deblocking aminopeptidase  29.71 
 
 
361 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000481551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4686  peptidase, M42 family  29.71 
 
 
361 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.124679999999999e-51 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4695  peptidase, M42 family  29.71 
 
 
361 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000157013  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2655  Cellulase  29.71 
 
 
361 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0558  peptidase, M42 family  29.71 
 
 
361 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000121832  hitchhiker  5.5021500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4679  peptidase, M42 family  29.71 
 
 
361 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000338182  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2409  Cellulase  32.07 
 
 
348 aa  158  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0709  cellulase  31.15 
 
 
351 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000744044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0803  Cellulase  30 
 
 
362 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1201  peptidase M42 family protein  33.72 
 
 
345 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.214071  normal  0.0232682 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2043  M42 family peptidase  31.86 
 
 
358 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0177  cellulase  31.47 
 
 
339 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2768  peptidase M42 family protein  31.25 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0002  cellulase  31.53 
 
 
365 aa  153  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0995  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  32.66 
 
 
349 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.383048 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1703  peptidase M42 family protein  30.43 
 
 
332 aa  151  1e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0214  cellulase  30.38 
 
 
357 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.880444  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1760  peptidase M42 family protein  29.86 
 
 
332 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0097  cellulase  29.88 
 
 
334 aa  147  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2478  Cellulase  31.59 
 
 
359 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0682  peptidase M42 family protein  31.53 
 
 
335 aa  146  5e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1505  cellulase  35.57 
 
 
345 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0441  cellulase  30.23 
 
 
350 aa  145  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.174946  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0468  cellulase  28.7 
 
 
350 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0307085  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0895  Cellulase  32.87 
 
 
355 aa  144  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1077  cellulase  29.2 
 
 
336 aa  143  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0394198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1551  cellulase  28.4 
 
 
350 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0368  cellulase  28.06 
 
 
350 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0158908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4885  glutamyl aminopeptidase  31.5 
 
 
360 aa  142  9e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1677  peptidase M42 family protein  30.21 
 
 
353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0376  peptidase M42 family protein  33.68 
 
 
346 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1495  Cellulase  32.11 
 
 
353 aa  140  3e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04171  predicted endoglucanase with Zn-dependent exopeptidase domain  29.63 
 
 
373 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3694  peptidase M42 family protein  29.63 
 
 
373 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04133  hypothetical protein  29.63 
 
 
373 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2482  cellulase  31.55 
 
 
358 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000313372  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2531  cellulase  31.55 
 
 
358 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126946  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0607  peptidase M42  32.43 
 
 
349 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.201581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1045  Glutamyl aminopeptidase  29.8 
 
 
360 aa  136  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0378  peptidase M42 family protein  29.08 
 
 
327 aa  135  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0609  peptidase M42  30.28 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.489423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1076  peptidase M42 family protein  31.09 
 
 
347 aa  134  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2259  Cellulase  27.9 
 
 
358 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0943649  unclonable  0.0000000415481 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0724  peptidase M42 family protein  28.17 
 
 
350 aa  132  7.999999999999999e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.143036  normal  0.785387 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0680  peptidase M42 family protein  28.49 
 
 
336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0354  peptidase M42 family protein  27.98 
 
 
346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.326213  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4288  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  28.82 
 
 
356 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0590  hypothetical protein  29.25 
 
 
352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03783  predicted endo-1,4-beta-glucanase  28.82 
 
 
356 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4086  Cellulase  28.82 
 
 
356 aa  130  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4126  putative fructose-specific phosphotransferase system protein FrvX  28.82 
 
 
356 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>